Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Opn3Q9WUK7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn3Q9WUK7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn3Q9WUK7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Opn3Q9WUK7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn3Q9WUK7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn3Q9WUK7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn3Q9WUK7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn3Q9WUK7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn3Q9WUK7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn3Q9WUK7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Opn3Q9WUK7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn3Q9WUK7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Opn3Q9WUK7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Opn3Q9WUK7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Opn3Q9WUK7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn3Q9WUK7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Opn3Q9WUK7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Opn3Q9WUK7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Opn3Q9WUK7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Opn3Q9WUK7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Opn3Q9WUK7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn3Q9WUK7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Opn3Q9WUK7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Opn3Q9WUK7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Opn3Q9WUK7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Opn3Q9WUK7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Opn3Q9WUK7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Opn3Q9WUK7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Opn3Q9WUK7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn3Q9WUK7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn3Q9WUK7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Opn3Q9WUK7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Opn3Q9WUK7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Opn3Q9WUK7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Opn3Q9WUK7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Opn3Q9WUK7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opn3Q9WUK7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn3Q9WUK7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn3Q9WUK7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn3Q9WUK7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn3Q9WUK7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn3Q9WUK7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Opn3Q9WUK7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Opn3Q9WUK7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Opn3Q9WUK7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn3Q9WUK7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn3Q9WUK7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn3Q9WUK7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Opn3Q9WUK7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Opn3Q9WUK7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn3Q9WUK7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn3Q9WUK7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn3Q9WUK7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn3Q9WUK7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn3Q9WUK7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn3Q9WUK7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn3Q9WUK7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn3Q9WUK7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opn3Q9WUK7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Opn3Q9WUK7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn3Q9WUK7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Opn3Q9WUK7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn3Q9WUK7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn3Q9WUK7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn3Q9WUK7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn3Q9WUK7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn3Q9WUK7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn3Q9WUK7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn3Q9WUK7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn3Q9WUK7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Opn3Q9WUK7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Opn3Q9WUK7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn3Q9WUK7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn3Q9WUK7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opn3Q9WUK7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn3Q9WUK7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opn3Q9WUK7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opn3Q9WUK7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn3Q9WUK7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opn3Q9WUK7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opn3Q9WUK7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn3Q9WUK7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn3Q9WUK7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn3Q9WUK7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn3Q9WUK7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn3Q9WUK7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn3Q9WUK7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn3Q9WUK7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn3Q9WUK7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn3Q9WUK7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Opn3Q9WUK7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn3Q9WUK7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn3Q9WUK7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn3Q9WUK7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn3Q9WUK7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn3Q9WUK7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Opn3Q9WUK7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn3Q9WUK7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Opn3Q9WUK7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms