Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Htra1Q9R118 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Htra1Q9R118 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Htra1Q9R118 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Htra1Q9R118 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Htra1Q9R118 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Htra1Q9R118 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Htra1Q9R118 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Htra1Q9R118 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Htra1Q9R118 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Htra1Q9R118 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Htra1Q9R118 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Htra1Q9R118 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Htra1Q9R118 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Htra1Q9R118 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Htra1Q9R118 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Htra1Q9R118 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htra1Q9R118 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Htra1Q9R118 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htra1Q9R118 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Htra1Q9R118 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Htra1Q9R118 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Htra1Q9R118 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htra1Q9R118 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htra1Q9R118 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Htra1Q9R118 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htra1Q9R118 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htra1Q9R118 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htra1Q9R118 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htra1Q9R118 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htra1Q9R118 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htra1Q9R118 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htra1Q9R118 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htra1Q9R118 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htra1Q9R118 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Htra1Q9R118 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htra1Q9R118 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htra1Q9R118 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Htra1Q9R118 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Htra1Q9R118 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htra1Q9R118 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Htra1Q9R118 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htra1Q9R118 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htra1Q9R118 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htra1Q9R118 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htra1Q9R118 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htra1Q9R118 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htra1Q9R118 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Htra1Q9R118 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Htra1Q9R118 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Htra1Q9R118 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Htra1Q9R118 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Htra1Q9R118 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Htra1Q9R118 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Htra1Q9R118 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htra1Q9R118 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htra1Q9R118 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htra1Q9R118 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htra1Q9R118 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htra1Q9R118 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htra1Q9R118 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htra1Q9R118 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htra1Q9R118 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htra1Q9R118 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htra1Q9R118 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Htra1Q9R118 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htra1Q9R118 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htra1Q9R118 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htra1Q9R118 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htra1Q9R118 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htra1Q9R118 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htra1Q9R118 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htra1Q9R118 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Htra1Q9R118 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htra1Q9R118 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htra1Q9R118 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htra1Q9R118 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htra1Q9R118 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htra1Q9R118 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htra1Q9R118 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Htra1Q9R118 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Htra1Q9R118 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htra1Q9R118 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htra1Q9R118 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Htra1Q9R118 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Htra1Q9R118 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htra1Q9R118 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htra1Q9R118 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htra1Q9R118 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms