Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syt6Q9R0N8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syt6Q9R0N8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syt6Q9R0N8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syt6Q9R0N8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syt6Q9R0N8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syt6Q9R0N8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syt6Q9R0N8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syt6Q9R0N8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syt6Q9R0N8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syt6Q9R0N8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syt6Q9R0N8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syt6Q9R0N8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syt6Q9R0N8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syt6Q9R0N8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syt6Q9R0N8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syt6Q9R0N8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syt6Q9R0N8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syt6Q9R0N8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syt6Q9R0N8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syt6Q9R0N8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syt6Q9R0N8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syt6Q9R0N8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syt6Q9R0N8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syt6Q9R0N8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syt6Q9R0N8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt6Q9R0N8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syt6Q9R0N8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syt6Q9R0N8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syt6Q9R0N8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syt6Q9R0N8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syt6Q9R0N8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syt6Q9R0N8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syt6Q9R0N8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syt6Q9R0N8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syt6Q9R0N8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Syt6Q9R0N8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syt6Q9R0N8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Syt6Q9R0N8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syt6Q9R0N8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syt6Q9R0N8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt6Q9R0N8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt6Q9R0N8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syt6Q9R0N8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt6Q9R0N8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt6Q9R0N8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt6Q9R0N8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt6Q9R0N8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syt6Q9R0N8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt6Q9R0N8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt6Q9R0N8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt6Q9R0N8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt6Q9R0N8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt6Q9R0N8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt6Q9R0N8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt6Q9R0N8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt6Q9R0N8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syt6Q9R0N8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt6Q9R0N8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt6Q9R0N8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt6Q9R0N8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt6Q9R0N8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syt6Q9R0N8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syt6Q9R0N8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syt6Q9R0N8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syt6Q9R0N8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syt6Q9R0N8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syt6Q9R0N8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt6Q9R0N8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt6Q9R0N8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt6Q9R0N8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syt6Q9R0N8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syt6Q9R0N8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt6Q9R0N8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syt6Q9R0N8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt6Q9R0N8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt6Q9R0N8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt6Q9R0N8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt6Q9R0N8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt6Q9R0N8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt6Q9R0N8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt6Q9R0N8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt6Q9R0N8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt6Q9R0N8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt6Q9R0N8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt6Q9R0N8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt6Q9R0N8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt6Q9R0N8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt6Q9R0N8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt6Q9R0N8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt6Q9R0N8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt6Q9R0N8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt6Q9R0N8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt6Q9R0N8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt6Q9R0N8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt6Q9R0N8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt6Q9R0N8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt6Q9R0N8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt6Q9R0N8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syt6Q9R0N8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms