Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,75■■■□□ 2,51
AmfrQ9R049 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
AmfrQ9R049 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
AmfrQ9R049 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
AmfrQ9R049 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
AmfrQ9R049 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
AmfrQ9R049 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
AmfrQ9R049 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,58■■■□□ 2,49
AmfrQ9R049 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
AmfrQ9R049 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
AmfrQ9R049 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
AmfrQ9R049 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
AmfrQ9R049 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
AmfrQ9R049 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
AmfrQ9R049 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
AmfrQ9R049 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
AmfrQ9R049 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,46
AmfrQ9R049 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
AmfrQ9R049 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
AmfrQ9R049 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
AmfrQ9R049 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
AmfrQ9R049 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
AmfrQ9R049 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
AmfrQ9R049 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
AmfrQ9R049 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
AmfrQ9R049 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
AmfrQ9R049 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
AmfrQ9R049 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
AmfrQ9R049 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
AmfrQ9R049 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
AmfrQ9R049 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,17■■■□□ 2,42
AmfrQ9R049 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,15■■■□□ 2,42
AmfrQ9R049 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
AmfrQ9R049 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,09■■■□□ 2,41
AmfrQ9R049 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,08■■■□□ 2,41
AmfrQ9R049 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
AmfrQ9R049 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
AmfrQ9R049 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
AmfrQ9R049 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
AmfrQ9R049 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
AmfrQ9R049 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
AmfrQ9R049 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
AmfrQ9R049 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
AmfrQ9R049 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
AmfrQ9R049 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
AmfrQ9R049 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
AmfrQ9R049 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
AmfrQ9R049 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
AmfrQ9R049 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
AmfrQ9R049 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
AmfrQ9R049 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,37
AmfrQ9R049 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
AmfrQ9R049 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
AmfrQ9R049 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
AmfrQ9R049 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
AmfrQ9R049 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
AmfrQ9R049 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
AmfrQ9R049 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
AmfrQ9R049 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
AmfrQ9R049 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
AmfrQ9R049 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
AmfrQ9R049 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
AmfrQ9R049 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
AmfrQ9R049 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
AmfrQ9R049 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
AmfrQ9R049 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,6■■■□□ 2,33
AmfrQ9R049 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,6■■■□□ 2,33
AmfrQ9R049 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
AmfrQ9R049 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,58■■■□□ 2,33
AmfrQ9R049 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
AmfrQ9R049 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,55■■■□□ 2,32
AmfrQ9R049 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,55■■■□□ 2,32
AmfrQ9R049 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
AmfrQ9R049 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
AmfrQ9R049 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
AmfrQ9R049 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
AmfrQ9R049 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
AmfrQ9R049 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
AmfrQ9R049 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
AmfrQ9R049 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
AmfrQ9R049 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
AmfrQ9R049 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
AmfrQ9R049 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
AmfrQ9R049 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
AmfrQ9R049 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
AmfrQ9R049 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
AmfrQ9R049 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
AmfrQ9R049 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
AmfrQ9R049 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,25■■■□□ 2,27
AmfrQ9R049 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
AmfrQ9R049 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
AmfrQ9R049 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
AmfrQ9R049 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
AmfrQ9R049 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
AmfrQ9R049 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
AmfrQ9R049 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
AmfrQ9R049 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,16■■■□□ 2,26
AmfrQ9R049 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
AmfrQ9R049 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
AmfrQ9R049 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,8 ms