Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cyth1Q9QX11 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Cyth1Q9QX11 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Cyth1Q9QX11 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Cyth1Q9QX11 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Cyth1Q9QX11 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Cyth1Q9QX11 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Cyth1Q9QX11 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cyth1Q9QX11 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Cyth1Q9QX11 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cyth1Q9QX11 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cyth1Q9QX11 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cyth1Q9QX11 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Cyth1Q9QX11 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cyth1Q9QX11 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cyth1Q9QX11 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Cyth1Q9QX11 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Cyth1Q9QX11 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cyth1Q9QX11 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cyth1Q9QX11 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cyth1Q9QX11 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cyth1Q9QX11 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Cyth1Q9QX11 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Cyth1Q9QX11 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cyth1Q9QX11 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cyth1Q9QX11 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cyth1Q9QX11 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cyth1Q9QX11 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cyth1Q9QX11 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Cyth1Q9QX11 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Cyth1Q9QX11 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Cyth1Q9QX11 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cyth1Q9QX11 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cyth1Q9QX11 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Cyth1Q9QX11 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Cyth1Q9QX11 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Cyth1Q9QX11 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cyth1Q9QX11 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cyth1Q9QX11 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Cyth1Q9QX11 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Cyth1Q9QX11 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cyth1Q9QX11 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Cyth1Q9QX11 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cyth1Q9QX11 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cyth1Q9QX11 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Cyth1Q9QX11 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cyth1Q9QX11 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Cyth1Q9QX11 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cyth1Q9QX11 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cyth1Q9QX11 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Cyth1Q9QX11 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Cyth1Q9QX11 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Cyth1Q9QX11 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Cyth1Q9QX11 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Cyth1Q9QX11 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Cyth1Q9QX11 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Cyth1Q9QX11 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Cyth1Q9QX11 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Cyth1Q9QX11 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,56■■■□□ 2
Cyth1Q9QX11 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Cyth1Q9QX11 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Cyth1Q9QX11 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Cyth1Q9QX11 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Cyth1Q9QX11 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cyth1Q9QX11 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Cyth1Q9QX11 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Cyth1Q9QX11 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Cyth1Q9QX11 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Cyth1Q9QX11 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Cyth1Q9QX11 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Cyth1Q9QX11 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Cyth1Q9QX11 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Cyth1Q9QX11 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cyth1Q9QX11 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cyth1Q9QX11 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Cyth1Q9QX11 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cyth1Q9QX11 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cyth1Q9QX11 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Cyth1Q9QX11 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cyth1Q9QX11 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cyth1Q9QX11 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cyth1Q9QX11 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cyth1Q9QX11 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cyth1Q9QX11 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cyth1Q9QX11 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyth1Q9QX11 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Cyth1Q9QX11 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cyth1Q9QX11 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Cyth1Q9QX11 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Cyth1Q9QX11 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cyth1Q9QX11 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cyth1Q9QX11 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cyth1Q9QX11 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cyth1Q9QX11 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cyth1Q9QX11 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cyth1Q9QX11 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cyth1Q9QX11 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cyth1Q9QX11 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cyth1Q9QX11 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Cyth1Q9QX11 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms