Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cyth1Q9QX11 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cyth1Q9QX11 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyth1Q9QX11 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyth1Q9QX11 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyth1Q9QX11 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyth1Q9QX11 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cyth1Q9QX11 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyth1Q9QX11 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyth1Q9QX11 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyth1Q9QX11 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyth1Q9QX11 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyth1Q9QX11 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyth1Q9QX11 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyth1Q9QX11 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyth1Q9QX11 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyth1Q9QX11 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyth1Q9QX11 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyth1Q9QX11 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyth1Q9QX11 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyth1Q9QX11 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyth1Q9QX11 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyth1Q9QX11 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyth1Q9QX11 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyth1Q9QX11 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyth1Q9QX11 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyth1Q9QX11 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyth1Q9QX11 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyth1Q9QX11 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyth1Q9QX11 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyth1Q9QX11 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cyth1Q9QX11 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyth1Q9QX11 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyth1Q9QX11 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyth1Q9QX11 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyth1Q9QX11 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyth1Q9QX11 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyth1Q9QX11 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyth1Q9QX11 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cyth1Q9QX11 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyth1Q9QX11 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyth1Q9QX11 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyth1Q9QX11 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyth1Q9QX11 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyth1Q9QX11 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyth1Q9QX11 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyth1Q9QX11 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyth1Q9QX11 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyth1Q9QX11 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyth1Q9QX11 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyth1Q9QX11 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyth1Q9QX11 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyth1Q9QX11 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyth1Q9QX11 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyth1Q9QX11 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyth1Q9QX11 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyth1Q9QX11 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyth1Q9QX11 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cyth1Q9QX11 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cyth1Q9QX11 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cyth1Q9QX11 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cyth1Q9QX11 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyth1Q9QX11 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyth1Q9QX11 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyth1Q9QX11 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyth1Q9QX11 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyth1Q9QX11 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyth1Q9QX11 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyth1Q9QX11 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyth1Q9QX11 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyth1Q9QX11 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cyth1Q9QX11 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyth1Q9QX11 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyth1Q9QX11 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyth1Q9QX11 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyth1Q9QX11 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyth1Q9QX11 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyth1Q9QX11 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cyth1Q9QX11 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cyth1Q9QX11 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cyth1Q9QX11 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyth1Q9QX11 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyth1Q9QX11 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cyth1Q9QX11 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cyth1Q9QX11 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cyth1Q9QX11 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cyth1Q9QX11 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cyth1Q9QX11 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cyth1Q9QX11 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cyth1Q9QX11 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyth1Q9QX11 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyth1Q9QX11 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyth1Q9QX11 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cyth1Q9QX11 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cyth1Q9QX11 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyth1Q9QX11 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyth1Q9QX11 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyth1Q9QX11 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cyth1Q9QX11 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cyth1Q9QX11 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms