Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Phc2Q9QWH1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Phc2Q9QWH1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Phc2Q9QWH1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Phc2Q9QWH1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Phc2Q9QWH1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Phc2Q9QWH1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Phc2Q9QWH1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Phc2Q9QWH1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phc2Q9QWH1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phc2Q9QWH1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Phc2Q9QWH1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Phc2Q9QWH1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Phc2Q9QWH1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Phc2Q9QWH1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Phc2Q9QWH1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Phc2Q9QWH1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Phc2Q9QWH1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Phc2Q9QWH1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Phc2Q9QWH1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Phc2Q9QWH1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Phc2Q9QWH1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phc2Q9QWH1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Phc2Q9QWH1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phc2Q9QWH1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Phc2Q9QWH1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Phc2Q9QWH1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phc2Q9QWH1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phc2Q9QWH1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Phc2Q9QWH1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Phc2Q9QWH1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Phc2Q9QWH1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Phc2Q9QWH1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phc2Q9QWH1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phc2Q9QWH1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phc2Q9QWH1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phc2Q9QWH1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phc2Q9QWH1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phc2Q9QWH1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phc2Q9QWH1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Phc2Q9QWH1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phc2Q9QWH1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Phc2Q9QWH1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phc2Q9QWH1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phc2Q9QWH1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phc2Q9QWH1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phc2Q9QWH1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phc2Q9QWH1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phc2Q9QWH1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phc2Q9QWH1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phc2Q9QWH1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phc2Q9QWH1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phc2Q9QWH1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phc2Q9QWH1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phc2Q9QWH1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phc2Q9QWH1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phc2Q9QWH1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phc2Q9QWH1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phc2Q9QWH1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phc2Q9QWH1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phc2Q9QWH1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phc2Q9QWH1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phc2Q9QWH1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Phc2Q9QWH1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phc2Q9QWH1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Phc2Q9QWH1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phc2Q9QWH1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phc2Q9QWH1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phc2Q9QWH1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phc2Q9QWH1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phc2Q9QWH1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phc2Q9QWH1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phc2Q9QWH1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phc2Q9QWH1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phc2Q9QWH1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Phc2Q9QWH1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phc2Q9QWH1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phc2Q9QWH1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phc2Q9QWH1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Phc2Q9QWH1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phc2Q9QWH1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phc2Q9QWH1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phc2Q9QWH1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phc2Q9QWH1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phc2Q9QWH1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Phc2Q9QWH1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phc2Q9QWH1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phc2Q9QWH1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phc2Q9QWH1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Phc2Q9QWH1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phc2Q9QWH1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phc2Q9QWH1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phc2Q9QWH1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phc2Q9QWH1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phc2Q9QWH1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phc2Q9QWH1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phc2Q9QWH1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phc2Q9QWH1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phc2Q9QWH1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phc2Q9QWH1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms