Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Phc2Q9QWH1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Phc2Q9QWH1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Phc2Q9QWH1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Phc2Q9QWH1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Phc2Q9QWH1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Phc2Q9QWH1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Phc2Q9QWH1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Phc2Q9QWH1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Phc2Q9QWH1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Phc2Q9QWH1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Phc2Q9QWH1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Phc2Q9QWH1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Phc2Q9QWH1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
Phc2Q9QWH1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Phc2Q9QWH1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Phc2Q9QWH1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Phc2Q9QWH1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Phc2Q9QWH1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Phc2Q9QWH1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Phc2Q9QWH1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Phc2Q9QWH1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Phc2Q9QWH1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Phc2Q9QWH1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Phc2Q9QWH1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Phc2Q9QWH1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Phc2Q9QWH1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Phc2Q9QWH1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Phc2Q9QWH1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Phc2Q9QWH1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Phc2Q9QWH1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Phc2Q9QWH1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
Phc2Q9QWH1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Phc2Q9QWH1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Phc2Q9QWH1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Phc2Q9QWH1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Phc2Q9QWH1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Phc2Q9QWH1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Phc2Q9QWH1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Phc2Q9QWH1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Phc2Q9QWH1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Phc2Q9QWH1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Phc2Q9QWH1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Phc2Q9QWH1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Phc2Q9QWH1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Phc2Q9QWH1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Phc2Q9QWH1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Phc2Q9QWH1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Phc2Q9QWH1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Phc2Q9QWH1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Phc2Q9QWH1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Phc2Q9QWH1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Phc2Q9QWH1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Phc2Q9QWH1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Phc2Q9QWH1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Phc2Q9QWH1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Phc2Q9QWH1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Phc2Q9QWH1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Phc2Q9QWH1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Phc2Q9QWH1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Phc2Q9QWH1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Phc2Q9QWH1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Phc2Q9QWH1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Phc2Q9QWH1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Phc2Q9QWH1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Phc2Q9QWH1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Phc2Q9QWH1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Phc2Q9QWH1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Phc2Q9QWH1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Phc2Q9QWH1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Phc2Q9QWH1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Phc2Q9QWH1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Phc2Q9QWH1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Phc2Q9QWH1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Phc2Q9QWH1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Phc2Q9QWH1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Phc2Q9QWH1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Phc2Q9QWH1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Phc2Q9QWH1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Phc2Q9QWH1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Phc2Q9QWH1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Phc2Q9QWH1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Phc2Q9QWH1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Phc2Q9QWH1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Phc2Q9QWH1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Phc2Q9QWH1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Phc2Q9QWH1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Phc2Q9QWH1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Phc2Q9QWH1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Phc2Q9QWH1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Phc2Q9QWH1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Phc2Q9QWH1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Phc2Q9QWH1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Phc2Q9QWH1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Phc2Q9QWH1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Phc2Q9QWH1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Phc2Q9QWH1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Phc2Q9QWH1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Phc2Q9QWH1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Phc2Q9QWH1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms