Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Hdgfl3Q9JMG7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,21■■□□□ 1,15
Hdgfl3Q9JMG7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Hdgfl3Q9JMG7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Hdgfl3Q9JMG7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,14■■□□□ 1,14
Hdgfl3Q9JMG7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Hdgfl3Q9JMG7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Hdgfl3Q9JMG7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Hdgfl3Q9JMG7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Hdgfl3Q9JMG7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Hdgfl3Q9JMG7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Hdgfl3Q9JMG7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Hdgfl3Q9JMG7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Hdgfl3Q9JMG7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Hdgfl3Q9JMG7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Hdgfl3Q9JMG7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Hdgfl3Q9JMG7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Hdgfl3Q9JMG7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Hdgfl3Q9JMG7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Hdgfl3Q9JMG7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Hdgfl3Q9JMG7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hdgfl3Q9JMG7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hdgfl3Q9JMG7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Hdgfl3Q9JMG7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hdgfl3Q9JMG7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Hdgfl3Q9JMG7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,77■■□□□ 1,08
Hdgfl3Q9JMG7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Hdgfl3Q9JMG7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Hdgfl3Q9JMG7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,72■■□□□ 1,07
Hdgfl3Q9JMG7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Hdgfl3Q9JMG7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Hdgfl3Q9JMG7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Hdgfl3Q9JMG7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Hdgfl3Q9JMG7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Hdgfl3Q9JMG7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Hdgfl3Q9JMG7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Hdgfl3Q9JMG7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Hdgfl3Q9JMG7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Hdgfl3Q9JMG7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Hdgfl3Q9JMG7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Hdgfl3Q9JMG7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Hdgfl3Q9JMG7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Hdgfl3Q9JMG7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Hdgfl3Q9JMG7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Hdgfl3Q9JMG7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Hdgfl3Q9JMG7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Hdgfl3Q9JMG7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Hdgfl3Q9JMG7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Hdgfl3Q9JMG7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Hdgfl3Q9JMG7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Hdgfl3Q9JMG7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Hdgfl3Q9JMG7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Hdgfl3Q9JMG7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,42■■□□□ 1,02
Hdgfl3Q9JMG7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Hdgfl3Q9JMG7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Hdgfl3Q9JMG7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Hdgfl3Q9JMG7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Hdgfl3Q9JMG7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Hdgfl3Q9JMG7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Hdgfl3Q9JMG7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Hdgfl3Q9JMG7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Hdgfl3Q9JMG7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,35■■□□□ 1,01
Hdgfl3Q9JMG7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Hdgfl3Q9JMG7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Hdgfl3Q9JMG7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Hdgfl3Q9JMG7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Hdgfl3Q9JMG7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Hdgfl3Q9JMG7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Hdgfl3Q9JMG7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Hdgfl3Q9JMG7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Hdgfl3Q9JMG7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21,17■□□□□ 0,98
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,16■□□□□ 0,98
Hdgfl3Q9JMG7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Hdgfl3Q9JMG7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,14■□□□□ 0,98
Hdgfl3Q9JMG7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,9 ms