Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgm1Q9JLF6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgm1Q9JLF6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tgm1Q9JLF6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tgm1Q9JLF6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgm1Q9JLF6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tgm1Q9JLF6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tgm1Q9JLF6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tgm1Q9JLF6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tgm1Q9JLF6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tgm1Q9JLF6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tgm1Q9JLF6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tgm1Q9JLF6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tgm1Q9JLF6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tgm1Q9JLF6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tgm1Q9JLF6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tgm1Q9JLF6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tgm1Q9JLF6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tgm1Q9JLF6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tgm1Q9JLF6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tgm1Q9JLF6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tgm1Q9JLF6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tgm1Q9JLF6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tgm1Q9JLF6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tgm1Q9JLF6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tgm1Q9JLF6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tgm1Q9JLF6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tgm1Q9JLF6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tgm1Q9JLF6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tgm1Q9JLF6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tgm1Q9JLF6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Tgm1Q9JLF6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tgm1Q9JLF6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tgm1Q9JLF6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tgm1Q9JLF6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tgm1Q9JLF6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tgm1Q9JLF6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tgm1Q9JLF6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tgm1Q9JLF6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tgm1Q9JLF6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tgm1Q9JLF6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tgm1Q9JLF6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tgm1Q9JLF6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgm1Q9JLF6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tgm1Q9JLF6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tgm1Q9JLF6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tgm1Q9JLF6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tgm1Q9JLF6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tgm1Q9JLF6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tgm1Q9JLF6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tgm1Q9JLF6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tgm1Q9JLF6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tgm1Q9JLF6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tgm1Q9JLF6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tgm1Q9JLF6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tgm1Q9JLF6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tgm1Q9JLF6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tgm1Q9JLF6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tgm1Q9JLF6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tgm1Q9JLF6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tgm1Q9JLF6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tgm1Q9JLF6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tgm1Q9JLF6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgm1Q9JLF6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgm1Q9JLF6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgm1Q9JLF6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tgm1Q9JLF6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgm1Q9JLF6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tgm1Q9JLF6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tgm1Q9JLF6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tgm1Q9JLF6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tgm1Q9JLF6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tgm1Q9JLF6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tgm1Q9JLF6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tgm1Q9JLF6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tgm1Q9JLF6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tgm1Q9JLF6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm1Q9JLF6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm1Q9JLF6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tgm1Q9JLF6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgm1Q9JLF6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgm1Q9JLF6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgm1Q9JLF6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgm1Q9JLF6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgm1Q9JLF6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgm1Q9JLF6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms