Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Habp4Q9JKS5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Habp4Q9JKS5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Habp4Q9JKS5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Habp4Q9JKS5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Habp4Q9JKS5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Habp4Q9JKS5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Habp4Q9JKS5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Habp4Q9JKS5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Habp4Q9JKS5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Habp4Q9JKS5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Habp4Q9JKS5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Habp4Q9JKS5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Habp4Q9JKS5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Habp4Q9JKS5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Habp4Q9JKS5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Habp4Q9JKS5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Habp4Q9JKS5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Habp4Q9JKS5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Habp4Q9JKS5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Habp4Q9JKS5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Habp4Q9JKS5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Habp4Q9JKS5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Habp4Q9JKS5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Habp4Q9JKS5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Habp4Q9JKS5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Habp4Q9JKS5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Habp4Q9JKS5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Habp4Q9JKS5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Habp4Q9JKS5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Habp4Q9JKS5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Habp4Q9JKS5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Habp4Q9JKS5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Habp4Q9JKS5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Habp4Q9JKS5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Habp4Q9JKS5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Habp4Q9JKS5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Habp4Q9JKS5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Habp4Q9JKS5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Habp4Q9JKS5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Habp4Q9JKS5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Habp4Q9JKS5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Habp4Q9JKS5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Habp4Q9JKS5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Habp4Q9JKS5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Habp4Q9JKS5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Habp4Q9JKS5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Habp4Q9JKS5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Habp4Q9JKS5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Habp4Q9JKS5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Habp4Q9JKS5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Habp4Q9JKS5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Habp4Q9JKS5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Habp4Q9JKS5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Habp4Q9JKS5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Habp4Q9JKS5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Habp4Q9JKS5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Habp4Q9JKS5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Habp4Q9JKS5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Habp4Q9JKS5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Habp4Q9JKS5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Habp4Q9JKS5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Habp4Q9JKS5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Habp4Q9JKS5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Habp4Q9JKS5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Habp4Q9JKS5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Habp4Q9JKS5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Habp4Q9JKS5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Habp4Q9JKS5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Habp4Q9JKS5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Habp4Q9JKS5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Habp4Q9JKS5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Habp4Q9JKS5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Habp4Q9JKS5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Habp4Q9JKS5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Habp4Q9JKS5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Habp4Q9JKS5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Habp4Q9JKS5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Habp4Q9JKS5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Habp4Q9JKS5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Habp4Q9JKS5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Habp4Q9JKS5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Habp4Q9JKS5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Habp4Q9JKS5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Habp4Q9JKS5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Habp4Q9JKS5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Habp4Q9JKS5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Habp4Q9JKS5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Habp4Q9JKS5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Habp4Q9JKS5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Habp4Q9JKS5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Habp4Q9JKS5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Habp4Q9JKS5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Habp4Q9JKS5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Habp4Q9JKS5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Habp4Q9JKS5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Habp4Q9JKS5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Habp4Q9JKS5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Habp4Q9JKS5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Habp4Q9JKS5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms