Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alyref2Q9JJW6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Alyref2Q9JJW6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alyref2Q9JJW6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alyref2Q9JJW6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Alyref2Q9JJW6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alyref2Q9JJW6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alyref2Q9JJW6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alyref2Q9JJW6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Alyref2Q9JJW6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Alyref2Q9JJW6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alyref2Q9JJW6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alyref2Q9JJW6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alyref2Q9JJW6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Alyref2Q9JJW6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alyref2Q9JJW6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alyref2Q9JJW6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alyref2Q9JJW6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alyref2Q9JJW6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alyref2Q9JJW6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Alyref2Q9JJW6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alyref2Q9JJW6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alyref2Q9JJW6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Alyref2Q9JJW6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Alyref2Q9JJW6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Alyref2Q9JJW6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alyref2Q9JJW6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alyref2Q9JJW6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alyref2Q9JJW6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Alyref2Q9JJW6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Alyref2Q9JJW6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Alyref2Q9JJW6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Alyref2Q9JJW6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Alyref2Q9JJW6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Alyref2Q9JJW6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Alyref2Q9JJW6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Alyref2Q9JJW6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Alyref2Q9JJW6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Alyref2Q9JJW6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Alyref2Q9JJW6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Alyref2Q9JJW6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Alyref2Q9JJW6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Alyref2Q9JJW6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Alyref2Q9JJW6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Alyref2Q9JJW6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alyref2Q9JJW6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Alyref2Q9JJW6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alyref2Q9JJW6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Alyref2Q9JJW6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alyref2Q9JJW6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alyref2Q9JJW6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alyref2Q9JJW6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alyref2Q9JJW6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alyref2Q9JJW6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alyref2Q9JJW6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Alyref2Q9JJW6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Alyref2Q9JJW6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alyref2Q9JJW6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alyref2Q9JJW6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alyref2Q9JJW6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alyref2Q9JJW6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alyref2Q9JJW6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alyref2Q9JJW6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alyref2Q9JJW6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alyref2Q9JJW6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alyref2Q9JJW6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alyref2Q9JJW6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alyref2Q9JJW6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alyref2Q9JJW6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alyref2Q9JJW6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alyref2Q9JJW6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alyref2Q9JJW6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alyref2Q9JJW6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Alyref2Q9JJW6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alyref2Q9JJW6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alyref2Q9JJW6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alyref2Q9JJW6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alyref2Q9JJW6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alyref2Q9JJW6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alyref2Q9JJW6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alyref2Q9JJW6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alyref2Q9JJW6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alyref2Q9JJW6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alyref2Q9JJW6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alyref2Q9JJW6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alyref2Q9JJW6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alyref2Q9JJW6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Alyref2Q9JJW6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Alyref2Q9JJW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alyref2Q9JJW6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alyref2Q9JJW6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Alyref2Q9JJW6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Alyref2Q9JJW6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alyref2Q9JJW6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alyref2Q9JJW6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alyref2Q9JJW6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alyref2Q9JJW6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Alyref2Q9JJW6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Alyref2Q9JJW6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms