Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Gfra4Q9JJT2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Gfra4Q9JJT2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Gfra4Q9JJT2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Gfra4Q9JJT2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Gfra4Q9JJT2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Gfra4Q9JJT2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Gfra4Q9JJT2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Gfra4Q9JJT2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Gfra4Q9JJT2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Gfra4Q9JJT2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Gfra4Q9JJT2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Gfra4Q9JJT2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Gfra4Q9JJT2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Gfra4Q9JJT2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Gfra4Q9JJT2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Gfra4Q9JJT2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Gfra4Q9JJT2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Gfra4Q9JJT2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Gfra4Q9JJT2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Gfra4Q9JJT2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gfra4Q9JJT2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Gfra4Q9JJT2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Gfra4Q9JJT2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Gfra4Q9JJT2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gfra4Q9JJT2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Gfra4Q9JJT2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
Gfra4Q9JJT2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gfra4Q9JJT2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gfra4Q9JJT2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gfra4Q9JJT2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gfra4Q9JJT2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gfra4Q9JJT2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gfra4Q9JJT2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gfra4Q9JJT2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Gfra4Q9JJT2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Gfra4Q9JJT2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Gfra4Q9JJT2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Gfra4Q9JJT2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gfra4Q9JJT2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gfra4Q9JJT2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gfra4Q9JJT2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gfra4Q9JJT2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gfra4Q9JJT2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gfra4Q9JJT2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gfra4Q9JJT2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Gfra4Q9JJT2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Gfra4Q9JJT2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Gfra4Q9JJT2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gfra4Q9JJT2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gfra4Q9JJT2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Gfra4Q9JJT2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Gfra4Q9JJT2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Gfra4Q9JJT2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Gfra4Q9JJT2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Gfra4Q9JJT2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Gfra4Q9JJT2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Gfra4Q9JJT2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Gfra4Q9JJT2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Gfra4Q9JJT2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Gfra4Q9JJT2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Gfra4Q9JJT2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gfra4Q9JJT2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Gfra4Q9JJT2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Gfra4Q9JJT2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Gfra4Q9JJT2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Gfra4Q9JJT2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Gfra4Q9JJT2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Gfra4Q9JJT2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Gfra4Q9JJT2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Gfra4Q9JJT2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Gfra4Q9JJT2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Gfra4Q9JJT2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Gfra4Q9JJT2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Gfra4Q9JJT2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Gfra4Q9JJT2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gfra4Q9JJT2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Gfra4Q9JJT2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Gfra4Q9JJT2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Gfra4Q9JJT2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gfra4Q9JJT2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gfra4Q9JJT2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gfra4Q9JJT2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Gfra4Q9JJT2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Gfra4Q9JJT2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gfra4Q9JJT2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gfra4Q9JJT2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Gfra4Q9JJT2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gfra4Q9JJT2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gfra4Q9JJT2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Gfra4Q9JJT2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Gfra4Q9JJT2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gfra4Q9JJT2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gfra4Q9JJT2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gfra4Q9JJT2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gfra4Q9JJT2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Gfra4Q9JJT2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Gfra4Q9JJT2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Gfra4Q9JJT2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,2 ms