Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gfra4Q9JJT2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gfra4Q9JJT2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gfra4Q9JJT2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Gfra4Q9JJT2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gfra4Q9JJT2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gfra4Q9JJT2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Gfra4Q9JJT2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Gfra4Q9JJT2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gfra4Q9JJT2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gfra4Q9JJT2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gfra4Q9JJT2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gfra4Q9JJT2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gfra4Q9JJT2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gfra4Q9JJT2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gfra4Q9JJT2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gfra4Q9JJT2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gfra4Q9JJT2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gfra4Q9JJT2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gfra4Q9JJT2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gfra4Q9JJT2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gfra4Q9JJT2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gfra4Q9JJT2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gfra4Q9JJT2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gfra4Q9JJT2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gfra4Q9JJT2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gfra4Q9JJT2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Gfra4Q9JJT2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gfra4Q9JJT2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gfra4Q9JJT2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gfra4Q9JJT2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gfra4Q9JJT2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gfra4Q9JJT2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gfra4Q9JJT2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gfra4Q9JJT2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gfra4Q9JJT2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gfra4Q9JJT2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gfra4Q9JJT2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gfra4Q9JJT2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gfra4Q9JJT2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gfra4Q9JJT2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gfra4Q9JJT2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gfra4Q9JJT2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gfra4Q9JJT2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gfra4Q9JJT2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gfra4Q9JJT2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gfra4Q9JJT2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gfra4Q9JJT2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gfra4Q9JJT2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gfra4Q9JJT2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gfra4Q9JJT2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gfra4Q9JJT2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gfra4Q9JJT2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gfra4Q9JJT2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gfra4Q9JJT2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gfra4Q9JJT2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gfra4Q9JJT2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gfra4Q9JJT2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gfra4Q9JJT2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gfra4Q9JJT2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gfra4Q9JJT2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gfra4Q9JJT2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gfra4Q9JJT2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gfra4Q9JJT2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gfra4Q9JJT2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gfra4Q9JJT2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gfra4Q9JJT2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gfra4Q9JJT2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gfra4Q9JJT2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gfra4Q9JJT2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gfra4Q9JJT2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gfra4Q9JJT2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gfra4Q9JJT2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gfra4Q9JJT2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gfra4Q9JJT2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gfra4Q9JJT2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gfra4Q9JJT2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Gfra4Q9JJT2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gfra4Q9JJT2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Gfra4Q9JJT2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gfra4Q9JJT2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gfra4Q9JJT2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gfra4Q9JJT2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gfra4Q9JJT2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Gfra4Q9JJT2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gfra4Q9JJT2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gfra4Q9JJT2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gfra4Q9JJT2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gfra4Q9JJT2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gfra4Q9JJT2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gfra4Q9JJT2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gfra4Q9JJT2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gfra4Q9JJT2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gfra4Q9JJT2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gfra4Q9JJT2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gfra4Q9JJT2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gfra4Q9JJT2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gfra4Q9JJT2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gfra4Q9JJT2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms