Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,15
Ssna1Q9JJ94 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,19■■□□□ 1,14
Ssna1Q9JJ94 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Ssna1Q9JJ94 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Ssna1Q9JJ94 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Ssna1Q9JJ94 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Ssna1Q9JJ94 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Ssna1Q9JJ94 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Ssna1Q9JJ94 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
Ssna1Q9JJ94 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ssna1Q9JJ94 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Ssna1Q9JJ94 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Ssna1Q9JJ94 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Ssna1Q9JJ94 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Ssna1Q9JJ94 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Ssna1Q9JJ94 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Ssna1Q9JJ94 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,11
Ssna1Q9JJ94 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Ssna1Q9JJ94 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ssna1Q9JJ94 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ssna1Q9JJ94 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ssna1Q9JJ94 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ssna1Q9JJ94 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ssna1Q9JJ94 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ssna1Q9JJ94 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ssna1Q9JJ94 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Ssna1Q9JJ94 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Ssna1Q9JJ94 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
Ssna1Q9JJ94 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ssna1Q9JJ94 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Ssna1Q9JJ94 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Ssna1Q9JJ94 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Ssna1Q9JJ94 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Ssna1Q9JJ94 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ssna1Q9JJ94 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ssna1Q9JJ94 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Ssna1Q9JJ94 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ssna1Q9JJ94 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Ssna1Q9JJ94 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Ssna1Q9JJ94 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,66■■□□□ 1,06
Ssna1Q9JJ94 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Ssna1Q9JJ94 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Ssna1Q9JJ94 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Ssna1Q9JJ94 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Ssna1Q9JJ94 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ssna1Q9JJ94 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ssna1Q9JJ94 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ssna1Q9JJ94 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Ssna1Q9JJ94 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ssna1Q9JJ94 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,55■■□□□ 1,04
Ssna1Q9JJ94 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Ssna1Q9JJ94 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Ssna1Q9JJ94 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ssna1Q9JJ94 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Ssna1Q9JJ94 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
Ssna1Q9JJ94 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Ssna1Q9JJ94 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Ssna1Q9JJ94 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Ssna1Q9JJ94 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Ssna1Q9JJ94 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Ssna1Q9JJ94 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ssna1Q9JJ94 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Ssna1Q9JJ94 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ssna1Q9JJ94 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ssna1Q9JJ94 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ssna1Q9JJ94 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ssna1Q9JJ94 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,42■■□□□ 1,02
Ssna1Q9JJ94 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Ssna1Q9JJ94 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Ssna1Q9JJ94 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Ssna1Q9JJ94 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Ssna1Q9JJ94 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Ssna1Q9JJ94 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
Ssna1Q9JJ94 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Ssna1Q9JJ94 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Ssna1Q9JJ94 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Ssna1Q9JJ94 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Ssna1Q9JJ94 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Ssna1Q9JJ94 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ssna1Q9JJ94 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ssna1Q9JJ94 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,3■■□□□ 1
Ssna1Q9JJ94 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,3■■□□□ 1
Ssna1Q9JJ94 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Ssna1Q9JJ94 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Ssna1Q9JJ94 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Ssna1Q9JJ94 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Ssna1Q9JJ94 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Ssna1Q9JJ94 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Ssna1Q9JJ94 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Ssna1Q9JJ94 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Ssna1Q9JJ94 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Ssna1Q9JJ94 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Ssna1Q9JJ94 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Ssna1Q9JJ94 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Ssna1Q9JJ94 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ssna1Q9JJ94 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ssna1Q9JJ94 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ssna1Q9JJ94 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Ssna1Q9JJ94 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ssna1Q9JJ94 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,4 ms