Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl1Q9JI74 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl1Q9JI74 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl1Q9JI74 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Klhl1Q9JI74 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl1Q9JI74 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl1Q9JI74 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl1Q9JI74 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl1Q9JI74 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl1Q9JI74 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl1Q9JI74 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl1Q9JI74 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl1Q9JI74 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl1Q9JI74 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klhl1Q9JI74 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klhl1Q9JI74 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl1Q9JI74 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klhl1Q9JI74 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Klhl1Q9JI74 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klhl1Q9JI74 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Klhl1Q9JI74 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Klhl1Q9JI74 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl1Q9JI74 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Klhl1Q9JI74 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Klhl1Q9JI74 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl1Q9JI74 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Klhl1Q9JI74 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Klhl1Q9JI74 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Klhl1Q9JI74 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klhl1Q9JI74 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klhl1Q9JI74 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhl1Q9JI74 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klhl1Q9JI74 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klhl1Q9JI74 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl1Q9JI74 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klhl1Q9JI74 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl1Q9JI74 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Klhl1Q9JI74 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Klhl1Q9JI74 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Klhl1Q9JI74 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Klhl1Q9JI74 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Klhl1Q9JI74 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Klhl1Q9JI74 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Klhl1Q9JI74 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Klhl1Q9JI74 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl1Q9JI74 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl1Q9JI74 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klhl1Q9JI74 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl1Q9JI74 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klhl1Q9JI74 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl1Q9JI74 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhl1Q9JI74 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl1Q9JI74 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl1Q9JI74 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl1Q9JI74 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl1Q9JI74 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl1Q9JI74 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl1Q9JI74 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl1Q9JI74 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl1Q9JI74 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl1Q9JI74 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Klhl1Q9JI74 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl1Q9JI74 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl1Q9JI74 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl1Q9JI74 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl1Q9JI74 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhl1Q9JI74 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl1Q9JI74 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl1Q9JI74 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl1Q9JI74 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klhl1Q9JI74 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl1Q9JI74 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl1Q9JI74 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl1Q9JI74 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl1Q9JI74 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl1Q9JI74 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl1Q9JI74 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl1Q9JI74 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl1Q9JI74 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl1Q9JI74 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl1Q9JI74 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl1Q9JI74 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl1Q9JI74 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klhl1Q9JI74 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl1Q9JI74 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl1Q9JI74 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl1Q9JI74 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl1Q9JI74 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl1Q9JI74 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl1Q9JI74 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms