Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI39

Abcb10, ATP-binding cassette sub-family B member 10, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb10Q9JI39 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcb10Q9JI39 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcb10Q9JI39 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcb10Q9JI39 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcb10Q9JI39 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcb10Q9JI39 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcb10Q9JI39 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcb10Q9JI39 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcb10Q9JI39 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcb10Q9JI39 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb10Q9JI39 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb10Q9JI39 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcb10Q9JI39 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcb10Q9JI39 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcb10Q9JI39 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcb10Q9JI39 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb10Q9JI39 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb10Q9JI39 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb10Q9JI39 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb10Q9JI39 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb10Q9JI39 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb10Q9JI39 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb10Q9JI39 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb10Q9JI39 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcb10Q9JI39 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcb10Q9JI39 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcb10Q9JI39 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcb10Q9JI39 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abcb10Q9JI39 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcb10Q9JI39 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abcb10Q9JI39 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcb10Q9JI39 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcb10Q9JI39 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcb10Q9JI39 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcb10Q9JI39 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcb10Q9JI39 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcb10Q9JI39 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb10Q9JI39 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcb10Q9JI39 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb10Q9JI39 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcb10Q9JI39 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcb10Q9JI39 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcb10Q9JI39 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb10Q9JI39 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb10Q9JI39 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcb10Q9JI39 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcb10Q9JI39 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb10Q9JI39 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcb10Q9JI39 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb10Q9JI39 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb10Q9JI39 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcb10Q9JI39 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb10Q9JI39 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb10Q9JI39 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcb10Q9JI39 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcb10Q9JI39 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb10Q9JI39 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb10Q9JI39 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcb10Q9JI39 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcb10Q9JI39 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb10Q9JI39 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb10Q9JI39 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcb10Q9JI39 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb10Q9JI39 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb10Q9JI39 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcb10Q9JI39 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcb10Q9JI39 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb10Q9JI39 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcb10Q9JI39 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb10Q9JI39 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb10Q9JI39 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcb10Q9JI39 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb10Q9JI39 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb10Q9JI39 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb10Q9JI39 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb10Q9JI39 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb10Q9JI39 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb10Q9JI39 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Abcb10Q9JI39 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcb10Q9JI39 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb10Q9JI39 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb10Q9JI39 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb10Q9JI39 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb10Q9JI39 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcb10Q9JI39 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcb10Q9JI39 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcb10Q9JI39 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcb10Q9JI39 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb10Q9JI39 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb10Q9JI39 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb10Q9JI39 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb10Q9JI39 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb10Q9JI39 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb10Q9JI39 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb10Q9JI39 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb10Q9JI39 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb10Q9JI39 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb10Q9JI39 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb10Q9JI39 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcb10Q9JI39 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms