Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET39

Slamf6, SLAM family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf6Q9ET39 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slamf6Q9ET39 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slamf6Q9ET39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slamf6Q9ET39 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slamf6Q9ET39 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slamf6Q9ET39 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slamf6Q9ET39 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slamf6Q9ET39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slamf6Q9ET39 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slamf6Q9ET39 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slamf6Q9ET39 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slamf6Q9ET39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slamf6Q9ET39 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slamf6Q9ET39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slamf6Q9ET39 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slamf6Q9ET39 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slamf6Q9ET39 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slamf6Q9ET39 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slamf6Q9ET39 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slamf6Q9ET39 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slamf6Q9ET39 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slamf6Q9ET39 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slamf6Q9ET39 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slamf6Q9ET39 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slamf6Q9ET39 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slamf6Q9ET39 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slamf6Q9ET39 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slamf6Q9ET39 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slamf6Q9ET39 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slamf6Q9ET39 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slamf6Q9ET39 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slamf6Q9ET39 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slamf6Q9ET39 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slamf6Q9ET39 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf6Q9ET39 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf6Q9ET39 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf6Q9ET39 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf6Q9ET39 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf6Q9ET39 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf6Q9ET39 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf6Q9ET39 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slamf6Q9ET39 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slamf6Q9ET39 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slamf6Q9ET39 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slamf6Q9ET39 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slamf6Q9ET39 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slamf6Q9ET39 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slamf6Q9ET39 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slamf6Q9ET39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slamf6Q9ET39 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slamf6Q9ET39 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slamf6Q9ET39 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slamf6Q9ET39 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slamf6Q9ET39 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slamf6Q9ET39 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slamf6Q9ET39 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slamf6Q9ET39 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slamf6Q9ET39 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slamf6Q9ET39 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slamf6Q9ET39 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slamf6Q9ET39 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slamf6Q9ET39 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slamf6Q9ET39 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slamf6Q9ET39 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slamf6Q9ET39 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slamf6Q9ET39 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slamf6Q9ET39 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slamf6Q9ET39 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slamf6Q9ET39 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slamf6Q9ET39 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slamf6Q9ET39 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slamf6Q9ET39 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slamf6Q9ET39 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slamf6Q9ET39 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slamf6Q9ET39 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slamf6Q9ET39 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slamf6Q9ET39 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slamf6Q9ET39 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slamf6Q9ET39 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms