Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ush1cQ9ES64 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ush1cQ9ES64 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ush1cQ9ES64 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ush1cQ9ES64 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ush1cQ9ES64 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ush1cQ9ES64 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ush1cQ9ES64 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ush1cQ9ES64 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ush1cQ9ES64 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ush1cQ9ES64 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ush1cQ9ES64 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ush1cQ9ES64 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ush1cQ9ES64 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Ush1cQ9ES64 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ush1cQ9ES64 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ush1cQ9ES64 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ush1cQ9ES64 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ush1cQ9ES64 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ush1cQ9ES64 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ush1cQ9ES64 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ush1cQ9ES64 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ush1cQ9ES64 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ush1cQ9ES64 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ush1cQ9ES64 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ush1cQ9ES64 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ush1cQ9ES64 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ush1cQ9ES64 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ush1cQ9ES64 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ush1cQ9ES64 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ush1cQ9ES64 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ush1cQ9ES64 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ush1cQ9ES64 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ush1cQ9ES64 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ush1cQ9ES64 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ush1cQ9ES64 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ush1cQ9ES64 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ush1cQ9ES64 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ush1cQ9ES64 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ush1cQ9ES64 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ush1cQ9ES64 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ush1cQ9ES64 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ush1cQ9ES64 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ush1cQ9ES64 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ush1cQ9ES64 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ush1cQ9ES64 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ush1cQ9ES64 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ush1cQ9ES64 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ush1cQ9ES64 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ush1cQ9ES64 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ush1cQ9ES64 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ush1cQ9ES64 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ush1cQ9ES64 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ush1cQ9ES64 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ush1cQ9ES64 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ush1cQ9ES64 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ush1cQ9ES64 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ush1cQ9ES64 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ush1cQ9ES64 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ush1cQ9ES64 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ush1cQ9ES64 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ush1cQ9ES64 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ush1cQ9ES64 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.2 ms