Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Strn3Q9ERG2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Strn3Q9ERG2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Strn3Q9ERG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Strn3Q9ERG2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Strn3Q9ERG2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Strn3Q9ERG2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Strn3Q9ERG2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Strn3Q9ERG2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Strn3Q9ERG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Strn3Q9ERG2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Strn3Q9ERG2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Strn3Q9ERG2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Strn3Q9ERG2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Strn3Q9ERG2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Strn3Q9ERG2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Strn3Q9ERG2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Strn3Q9ERG2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Strn3Q9ERG2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Strn3Q9ERG2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn3Q9ERG2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn3Q9ERG2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Strn3Q9ERG2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Strn3Q9ERG2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Strn3Q9ERG2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Strn3Q9ERG2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Strn3Q9ERG2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Strn3Q9ERG2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Strn3Q9ERG2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Strn3Q9ERG2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Strn3Q9ERG2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Strn3Q9ERG2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Strn3Q9ERG2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Strn3Q9ERG2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Strn3Q9ERG2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strn3Q9ERG2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Strn3Q9ERG2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Strn3Q9ERG2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Strn3Q9ERG2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Strn3Q9ERG2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Strn3Q9ERG2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Strn3Q9ERG2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Strn3Q9ERG2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Strn3Q9ERG2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Strn3Q9ERG2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Strn3Q9ERG2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Strn3Q9ERG2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Strn3Q9ERG2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Strn3Q9ERG2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Strn3Q9ERG2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Strn3Q9ERG2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strn3Q9ERG2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strn3Q9ERG2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strn3Q9ERG2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Strn3Q9ERG2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Strn3Q9ERG2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Strn3Q9ERG2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Strn3Q9ERG2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Strn3Q9ERG2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Strn3Q9ERG2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Strn3Q9ERG2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Strn3Q9ERG2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Strn3Q9ERG2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Strn3Q9ERG2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Strn3Q9ERG2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strn3Q9ERG2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strn3Q9ERG2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Strn3Q9ERG2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Strn3Q9ERG2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Strn3Q9ERG2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Strn3Q9ERG2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Strn3Q9ERG2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Strn3Q9ERG2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Strn3Q9ERG2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Strn3Q9ERG2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Strn3Q9ERG2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Strn3Q9ERG2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Strn3Q9ERG2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Strn3Q9ERG2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Strn3Q9ERG2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Strn3Q9ERG2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Strn3Q9ERG2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Strn3Q9ERG2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Strn3Q9ERG2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Strn3Q9ERG2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Strn3Q9ERG2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Strn3Q9ERG2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Strn3Q9ERG2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Strn3Q9ERG2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Strn3Q9ERG2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Strn3Q9ERG2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Strn3Q9ERG2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Strn3Q9ERG2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Strn3Q9ERG2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Strn3Q9ERG2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Strn3Q9ERG2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Strn3Q9ERG2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Strn3Q9ERG2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Strn3Q9ERG2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Strn3Q9ERG2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms