Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER73

Elp4, Elongator complex protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp4Q9ER73 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Elp4Q9ER73 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Elp4Q9ER73 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp4Q9ER73 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp4Q9ER73 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Elp4Q9ER73 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Elp4Q9ER73 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Elp4Q9ER73 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Elp4Q9ER73 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Elp4Q9ER73 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Elp4Q9ER73 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Elp4Q9ER73 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Elp4Q9ER73 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Elp4Q9ER73 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Elp4Q9ER73 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Elp4Q9ER73 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Elp4Q9ER73 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Elp4Q9ER73 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Elp4Q9ER73 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Elp4Q9ER73 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Elp4Q9ER73 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Elp4Q9ER73 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Elp4Q9ER73 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Elp4Q9ER73 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Elp4Q9ER73 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Elp4Q9ER73 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Elp4Q9ER73 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Elp4Q9ER73 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Elp4Q9ER73 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Elp4Q9ER73 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp4Q9ER73 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp4Q9ER73 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp4Q9ER73 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elp4Q9ER73 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elp4Q9ER73 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elp4Q9ER73 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Elp4Q9ER73 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Elp4Q9ER73 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Elp4Q9ER73 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Elp4Q9ER73 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Elp4Q9ER73 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Elp4Q9ER73 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Elp4Q9ER73 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Elp4Q9ER73 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp4Q9ER73 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elp4Q9ER73 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Elp4Q9ER73 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Elp4Q9ER73 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Elp4Q9ER73 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Elp4Q9ER73 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Elp4Q9ER73 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Elp4Q9ER73 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Elp4Q9ER73 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elp4Q9ER73 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elp4Q9ER73 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elp4Q9ER73 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elp4Q9ER73 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elp4Q9ER73 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Elp4Q9ER73 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Elp4Q9ER73 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Elp4Q9ER73 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elp4Q9ER73 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elp4Q9ER73 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Elp4Q9ER73 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elp4Q9ER73 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp4Q9ER73 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp4Q9ER73 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elp4Q9ER73 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elp4Q9ER73 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elp4Q9ER73 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elp4Q9ER73 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elp4Q9ER73 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Elp4Q9ER73 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Elp4Q9ER73 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elp4Q9ER73 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elp4Q9ER73 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elp4Q9ER73 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp4Q9ER73 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Elp4Q9ER73 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elp4Q9ER73 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Elp4Q9ER73 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Elp4Q9ER73 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Elp4Q9ER73 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Elp4Q9ER73 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Elp4Q9ER73 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Elp4Q9ER73 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elp4Q9ER73 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elp4Q9ER73 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elp4Q9ER73 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Elp4Q9ER73 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Elp4Q9ER73 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Elp4Q9ER73 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Elp4Q9ER73 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Elp4Q9ER73 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Elp4Q9ER73 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Elp4Q9ER73 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Elp4Q9ER73 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Elp4Q9ER73 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Elp4Q9ER73 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Elp4Q9ER73 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms