Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ropn1lQ9EQ00 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ropn1lQ9EQ00 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ropn1lQ9EQ00 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ropn1lQ9EQ00 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ropn1lQ9EQ00 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ropn1lQ9EQ00 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ropn1lQ9EQ00 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ropn1lQ9EQ00 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ropn1lQ9EQ00 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ropn1lQ9EQ00 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ropn1lQ9EQ00 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ropn1lQ9EQ00 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ropn1lQ9EQ00 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ropn1lQ9EQ00 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ropn1lQ9EQ00 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ropn1lQ9EQ00 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ropn1lQ9EQ00 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ropn1lQ9EQ00 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ropn1lQ9EQ00 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ropn1lQ9EQ00 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ropn1lQ9EQ00 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ropn1lQ9EQ00 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ropn1lQ9EQ00 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ropn1lQ9EQ00 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ropn1lQ9EQ00 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ropn1lQ9EQ00 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ropn1lQ9EQ00 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ropn1lQ9EQ00 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ropn1lQ9EQ00 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ropn1lQ9EQ00 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ropn1lQ9EQ00 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ropn1lQ9EQ00 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ropn1lQ9EQ00 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ropn1lQ9EQ00 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ropn1lQ9EQ00 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ropn1lQ9EQ00 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ropn1lQ9EQ00 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ropn1lQ9EQ00 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ropn1lQ9EQ00 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ropn1lQ9EQ00 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ropn1lQ9EQ00 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ropn1lQ9EQ00 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ropn1lQ9EQ00 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ropn1lQ9EQ00 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ropn1lQ9EQ00 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ropn1lQ9EQ00 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ropn1lQ9EQ00 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ropn1lQ9EQ00 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ropn1lQ9EQ00 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ropn1lQ9EQ00 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ropn1lQ9EQ00 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ropn1lQ9EQ00 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ropn1lQ9EQ00 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ropn1lQ9EQ00 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ropn1lQ9EQ00 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ropn1lQ9EQ00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ropn1lQ9EQ00 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ropn1lQ9EQ00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ropn1lQ9EQ00 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ropn1lQ9EQ00 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ropn1lQ9EQ00 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ropn1lQ9EQ00 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ropn1lQ9EQ00 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ropn1lQ9EQ00 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ropn1lQ9EQ00 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ropn1lQ9EQ00 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ropn1lQ9EQ00 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ropn1lQ9EQ00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ropn1lQ9EQ00 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ropn1lQ9EQ00 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ropn1lQ9EQ00 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ropn1lQ9EQ00 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ropn1lQ9EQ00 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ropn1lQ9EQ00 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ropn1lQ9EQ00 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ropn1lQ9EQ00 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ropn1lQ9EQ00 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ropn1lQ9EQ00 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ropn1lQ9EQ00 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ropn1lQ9EQ00 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ropn1lQ9EQ00 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ropn1lQ9EQ00 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ropn1lQ9EQ00 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ropn1lQ9EQ00 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms