Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ropn1lQ9EQ00 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ropn1lQ9EQ00 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ropn1lQ9EQ00 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
Ropn1lQ9EQ00 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Ropn1lQ9EQ00 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ropn1lQ9EQ00 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Ropn1lQ9EQ00 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Ropn1lQ9EQ00 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Ropn1lQ9EQ00 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Ropn1lQ9EQ00 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Ropn1lQ9EQ00 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ropn1lQ9EQ00 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ropn1lQ9EQ00 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ropn1lQ9EQ00 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ropn1lQ9EQ00 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ropn1lQ9EQ00 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ropn1lQ9EQ00 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ropn1lQ9EQ00 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ropn1lQ9EQ00 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ropn1lQ9EQ00 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ropn1lQ9EQ00 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ropn1lQ9EQ00 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ropn1lQ9EQ00 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ropn1lQ9EQ00 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ropn1lQ9EQ00 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ropn1lQ9EQ00 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ropn1lQ9EQ00 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ropn1lQ9EQ00 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ropn1lQ9EQ00 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ropn1lQ9EQ00 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ropn1lQ9EQ00 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ropn1lQ9EQ00 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ropn1lQ9EQ00 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ropn1lQ9EQ00 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ropn1lQ9EQ00 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Ropn1lQ9EQ00 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Ropn1lQ9EQ00 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Ropn1lQ9EQ00 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Ropn1lQ9EQ00 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Ropn1lQ9EQ00 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,42■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,39■■□□□ 1,34
Ropn1lQ9EQ00 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ropn1lQ9EQ00 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Ropn1lQ9EQ00 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ropn1lQ9EQ00 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Ropn1lQ9EQ00 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,33■■□□□ 1,32
Ropn1lQ9EQ00 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ropn1lQ9EQ00 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ropn1lQ9EQ00 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ropn1lQ9EQ00 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ropn1lQ9EQ00 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ropn1lQ9EQ00 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ropn1lQ9EQ00 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ropn1lQ9EQ00 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ropn1lQ9EQ00 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ropn1lQ9EQ00 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Ropn1lQ9EQ00 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ropn1lQ9EQ00 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ropn1lQ9EQ00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ropn1lQ9EQ00 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ropn1lQ9EQ00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ropn1lQ9EQ00 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Ropn1lQ9EQ00 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ropn1lQ9EQ00 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ropn1lQ9EQ00 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ropn1lQ9EQ00 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ropn1lQ9EQ00 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ropn1lQ9EQ00 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ropn1lQ9EQ00 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ropn1lQ9EQ00 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ropn1lQ9EQ00 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ropn1lQ9EQ00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ropn1lQ9EQ00 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Ropn1lQ9EQ00 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ropn1lQ9EQ00 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ropn1lQ9EQ00 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ropn1lQ9EQ00 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ropn1lQ9EQ00 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ropn1lQ9EQ00 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ropn1lQ9EQ00 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ropn1lQ9EQ00 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ropn1lQ9EQ00 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ropn1lQ9EQ00 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ropn1lQ9EQ00 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ropn1lQ9EQ00 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ropn1lQ9EQ00 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ropn1lQ9EQ00 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
Ropn1lQ9EQ00 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,7 ms