Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn1r56Q9EPS9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn1r56Q9EPS9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn1r56Q9EPS9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn1r56Q9EPS9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r56Q9EPS9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r56Q9EPS9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r56Q9EPS9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r56Q9EPS9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r56Q9EPS9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r56Q9EPS9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r56Q9EPS9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r56Q9EPS9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r56Q9EPS9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r56Q9EPS9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r56Q9EPS9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r56Q9EPS9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r56Q9EPS9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r56Q9EPS9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r56Q9EPS9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r56Q9EPS9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r56Q9EPS9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r56Q9EPS9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r56Q9EPS9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r56Q9EPS9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r56Q9EPS9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r56Q9EPS9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r56Q9EPS9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r56Q9EPS9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r56Q9EPS9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r56Q9EPS9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vmn1r56Q9EPS9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r56Q9EPS9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r56Q9EPS9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r56Q9EPS9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r56Q9EPS9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r56Q9EPS9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r56Q9EPS9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn1r56Q9EPS9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r56Q9EPS9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r56Q9EPS9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r56Q9EPS9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r56Q9EPS9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r56Q9EPS9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r56Q9EPS9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r56Q9EPS9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn1r56Q9EPS9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r56Q9EPS9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r56Q9EPS9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r56Q9EPS9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r56Q9EPS9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r56Q9EPS9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r56Q9EPS9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r56Q9EPS9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r56Q9EPS9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r56Q9EPS9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r56Q9EPS9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r56Q9EPS9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r56Q9EPS9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r56Q9EPS9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r56Q9EPS9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r56Q9EPS9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r56Q9EPS9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r56Q9EPS9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r56Q9EPS9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r56Q9EPS9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r56Q9EPS9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r56Q9EPS9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r56Q9EPS9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r56Q9EPS9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r56Q9EPS9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r56Q9EPS9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r56Q9EPS9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r56Q9EPS9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r56Q9EPS9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r56Q9EPS9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r56Q9EPS9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r56Q9EPS9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r56Q9EPS9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r56Q9EPS9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r56Q9EPS9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r56Q9EPS9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r56Q9EPS9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r56Q9EPS9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r56Q9EPS9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r56Q9EPS9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r56Q9EPS9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r56Q9EPS9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r56Q9EPS9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r56Q9EPS9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r56Q9EPS9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r56Q9EPS9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r56Q9EPS9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r56Q9EPS9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r56Q9EPS9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r56Q9EPS9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r56Q9EPS9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r56Q9EPS9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r56Q9EPS9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.7 ms