Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr1Q9EPQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr1Q9EPQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr1Q9EPQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr1Q9EPQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr1Q9EPQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr1Q9EPQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr1Q9EPQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr1Q9EPQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr1Q9EPQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr1Q9EPQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr1Q9EPQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr1Q9EPQ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr1Q9EPQ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr1Q9EPQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr1Q9EPQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr1Q9EPQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr1Q9EPQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr1Q9EPQ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tlr1Q9EPQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr1Q9EPQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr1Q9EPQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlr1Q9EPQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr1Q9EPQ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlr1Q9EPQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlr1Q9EPQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tlr1Q9EPQ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlr1Q9EPQ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlr1Q9EPQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlr1Q9EPQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr1Q9EPQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr1Q9EPQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr1Q9EPQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr1Q9EPQ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr1Q9EPQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr1Q9EPQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr1Q9EPQ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr1Q9EPQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr1Q9EPQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr1Q9EPQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr1Q9EPQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlr1Q9EPQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tlr1Q9EPQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms