Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rnf138rt1Q9D9M9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnf138rt1Q9D9M9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf138rt1Q9D9M9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rnf138rt1Q9D9M9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rnf138rt1Q9D9M9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf138rt1Q9D9M9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf138rt1Q9D9M9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rnf138rt1Q9D9M9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf138rt1Q9D9M9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf138rt1Q9D9M9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf138rt1Q9D9M9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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