Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Z6

Atg101, Autophagy-related protein 101, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg101Q9D8Z6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg101Q9D8Z6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg101Q9D8Z6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg101Q9D8Z6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg101Q9D8Z6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg101Q9D8Z6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg101Q9D8Z6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg101Q9D8Z6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg101Q9D8Z6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg101Q9D8Z6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg101Q9D8Z6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg101Q9D8Z6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg101Q9D8Z6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg101Q9D8Z6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg101Q9D8Z6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg101Q9D8Z6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg101Q9D8Z6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg101Q9D8Z6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg101Q9D8Z6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg101Q9D8Z6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg101Q9D8Z6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg101Q9D8Z6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg101Q9D8Z6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg101Q9D8Z6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg101Q9D8Z6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg101Q9D8Z6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg101Q9D8Z6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg101Q9D8Z6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg101Q9D8Z6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg101Q9D8Z6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg101Q9D8Z6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg101Q9D8Z6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg101Q9D8Z6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg101Q9D8Z6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg101Q9D8Z6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg101Q9D8Z6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg101Q9D8Z6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg101Q9D8Z6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg101Q9D8Z6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg101Q9D8Z6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg101Q9D8Z6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg101Q9D8Z6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg101Q9D8Z6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg101Q9D8Z6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg101Q9D8Z6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg101Q9D8Z6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg101Q9D8Z6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg101Q9D8Z6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg101Q9D8Z6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg101Q9D8Z6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg101Q9D8Z6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg101Q9D8Z6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg101Q9D8Z6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg101Q9D8Z6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg101Q9D8Z6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg101Q9D8Z6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg101Q9D8Z6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg101Q9D8Z6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg101Q9D8Z6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg101Q9D8Z6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg101Q9D8Z6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg101Q9D8Z6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg101Q9D8Z6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg101Q9D8Z6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg101Q9D8Z6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg101Q9D8Z6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg101Q9D8Z6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg101Q9D8Z6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg101Q9D8Z6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg101Q9D8Z6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg101Q9D8Z6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg101Q9D8Z6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg101Q9D8Z6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg101Q9D8Z6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg101Q9D8Z6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg101Q9D8Z6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg101Q9D8Z6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg101Q9D8Z6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg101Q9D8Z6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg101Q9D8Z6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atg101Q9D8Z6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg101Q9D8Z6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg101Q9D8Z6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg101Q9D8Z6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg101Q9D8Z6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg101Q9D8Z6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg101Q9D8Z6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg101Q9D8Z6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms