Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabra4Q9D6F4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabra4Q9D6F4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabra4Q9D6F4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabra4Q9D6F4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gabra4Q9D6F4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabra4Q9D6F4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabra4Q9D6F4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabra4Q9D6F4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabra4Q9D6F4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabra4Q9D6F4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabra4Q9D6F4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabra4Q9D6F4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabra4Q9D6F4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabra4Q9D6F4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabra4Q9D6F4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabra4Q9D6F4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabra4Q9D6F4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabra4Q9D6F4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabra4Q9D6F4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabra4Q9D6F4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabra4Q9D6F4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabra4Q9D6F4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabra4Q9D6F4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabra4Q9D6F4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabra4Q9D6F4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabra4Q9D6F4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabra4Q9D6F4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabra4Q9D6F4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabra4Q9D6F4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabra4Q9D6F4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabra4Q9D6F4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabra4Q9D6F4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabra4Q9D6F4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabra4Q9D6F4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabra4Q9D6F4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabra4Q9D6F4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabra4Q9D6F4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabra4Q9D6F4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabra4Q9D6F4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabra4Q9D6F4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabra4Q9D6F4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabra4Q9D6F4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gabra4Q9D6F4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gabra4Q9D6F4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabra4Q9D6F4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabra4Q9D6F4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabra4Q9D6F4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabra4Q9D6F4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabra4Q9D6F4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabra4Q9D6F4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabra4Q9D6F4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabra4Q9D6F4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabra4Q9D6F4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabra4Q9D6F4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabra4Q9D6F4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabra4Q9D6F4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabra4Q9D6F4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabra4Q9D6F4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabra4Q9D6F4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gabra4Q9D6F4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabra4Q9D6F4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabra4Q9D6F4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabra4Q9D6F4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabra4Q9D6F4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabra4Q9D6F4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabra4Q9D6F4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabra4Q9D6F4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabra4Q9D6F4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabra4Q9D6F4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabra4Q9D6F4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabra4Q9D6F4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabra4Q9D6F4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabra4Q9D6F4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabra4Q9D6F4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabra4Q9D6F4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabra4Q9D6F4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabra4Q9D6F4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabra4Q9D6F4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabra4Q9D6F4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabra4Q9D6F4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabra4Q9D6F4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabra4Q9D6F4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabra4Q9D6F4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabra4Q9D6F4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabra4Q9D6F4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabra4Q9D6F4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra4Q9D6F4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabra4Q9D6F4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabra4Q9D6F4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabra4Q9D6F4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabra4Q9D6F4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabra4Q9D6F4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabra4Q9D6F4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabra4Q9D6F4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra4Q9D6F4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabra4Q9D6F4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabra4Q9D6F4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabra4Q9D6F4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabra4Q9D6F4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms