Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4933428G20RikQ9D3X4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
4933428G20RikQ9D3X4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
4933428G20RikQ9D3X4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4933428G20RikQ9D3X4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4933428G20RikQ9D3X4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4933428G20RikQ9D3X4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
4933428G20RikQ9D3X4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
4933428G20RikQ9D3X4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
4933428G20RikQ9D3X4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
4933428G20RikQ9D3X4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
4933428G20RikQ9D3X4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4933428G20RikQ9D3X4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms