Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Batf3Q9D275 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Batf3Q9D275 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Batf3Q9D275 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Batf3Q9D275 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Batf3Q9D275 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Batf3Q9D275 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Batf3Q9D275 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Batf3Q9D275 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Batf3Q9D275 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Batf3Q9D275 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Batf3Q9D275 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Batf3Q9D275 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Batf3Q9D275 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Batf3Q9D275 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Batf3Q9D275 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Batf3Q9D275 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Batf3Q9D275 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Batf3Q9D275 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Batf3Q9D275 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Batf3Q9D275 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Batf3Q9D275 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Batf3Q9D275 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Batf3Q9D275 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Batf3Q9D275 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Batf3Q9D275 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Batf3Q9D275 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Batf3Q9D275 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Batf3Q9D275 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Batf3Q9D275 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Batf3Q9D275 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Batf3Q9D275 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Batf3Q9D275 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Batf3Q9D275 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Batf3Q9D275 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Batf3Q9D275 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Batf3Q9D275 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Batf3Q9D275 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Batf3Q9D275 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Batf3Q9D275 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Batf3Q9D275 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Batf3Q9D275 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Batf3Q9D275 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Batf3Q9D275 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Batf3Q9D275 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Batf3Q9D275 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Batf3Q9D275 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Batf3Q9D275 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Batf3Q9D275 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Batf3Q9D275 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Batf3Q9D275 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Batf3Q9D275 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Batf3Q9D275 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Batf3Q9D275 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Batf3Q9D275 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Batf3Q9D275 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Batf3Q9D275 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Batf3Q9D275 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Batf3Q9D275 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Batf3Q9D275 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Batf3Q9D275 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Batf3Q9D275 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Batf3Q9D275 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Batf3Q9D275 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Batf3Q9D275 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Batf3Q9D275 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Batf3Q9D275 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Batf3Q9D275 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Batf3Q9D275 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Batf3Q9D275 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Batf3Q9D275 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Batf3Q9D275 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Batf3Q9D275 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Batf3Q9D275 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Batf3Q9D275 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Batf3Q9D275 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Batf3Q9D275 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Batf3Q9D275 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Batf3Q9D275 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Batf3Q9D275 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Batf3Q9D275 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Batf3Q9D275 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Batf3Q9D275 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Batf3Q9D275 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Batf3Q9D275 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Batf3Q9D275 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Batf3Q9D275 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Batf3Q9D275 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Batf3Q9D275 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Batf3Q9D275 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Batf3Q9D275 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Batf3Q9D275 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Batf3Q9D275 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Batf3Q9D275 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Batf3Q9D275 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Batf3Q9D275 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Batf3Q9D275 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Batf3Q9D275 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Batf3Q9D275 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Batf3Q9D275 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms