Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2cQ9D1C1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2cQ9D1C1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2cQ9D1C1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2cQ9D1C1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2cQ9D1C1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube2cQ9D1C1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2cQ9D1C1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2cQ9D1C1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2cQ9D1C1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2cQ9D1C1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2cQ9D1C1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2cQ9D1C1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2cQ9D1C1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2cQ9D1C1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2cQ9D1C1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2cQ9D1C1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2cQ9D1C1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2cQ9D1C1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2cQ9D1C1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2cQ9D1C1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2cQ9D1C1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2cQ9D1C1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube2cQ9D1C1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2cQ9D1C1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2cQ9D1C1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2cQ9D1C1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2cQ9D1C1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2cQ9D1C1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2cQ9D1C1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2cQ9D1C1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2cQ9D1C1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2cQ9D1C1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2cQ9D1C1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2cQ9D1C1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2cQ9D1C1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2cQ9D1C1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2cQ9D1C1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube2cQ9D1C1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2cQ9D1C1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2cQ9D1C1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2cQ9D1C1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2cQ9D1C1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ube2cQ9D1C1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube2cQ9D1C1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2cQ9D1C1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ube2cQ9D1C1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2cQ9D1C1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2cQ9D1C1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube2cQ9D1C1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube2cQ9D1C1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube2cQ9D1C1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube2cQ9D1C1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube2cQ9D1C1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube2cQ9D1C1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube2cQ9D1C1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube2cQ9D1C1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube2cQ9D1C1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube2cQ9D1C1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube2cQ9D1C1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube2cQ9D1C1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2cQ9D1C1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ube2cQ9D1C1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2cQ9D1C1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ube2cQ9D1C1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2cQ9D1C1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ube2cQ9D1C1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2cQ9D1C1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ube2cQ9D1C1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2cQ9D1C1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2cQ9D1C1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2cQ9D1C1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2cQ9D1C1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2cQ9D1C1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2cQ9D1C1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2cQ9D1C1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2cQ9D1C1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2cQ9D1C1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2cQ9D1C1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ube2cQ9D1C1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ube2cQ9D1C1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2cQ9D1C1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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