Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl28Q9D1B9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl28Q9D1B9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl28Q9D1B9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl28Q9D1B9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl28Q9D1B9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl28Q9D1B9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl28Q9D1B9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl28Q9D1B9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl28Q9D1B9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl28Q9D1B9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl28Q9D1B9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl28Q9D1B9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl28Q9D1B9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl28Q9D1B9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl28Q9D1B9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl28Q9D1B9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl28Q9D1B9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl28Q9D1B9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl28Q9D1B9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl28Q9D1B9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl28Q9D1B9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl28Q9D1B9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl28Q9D1B9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl28Q9D1B9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl28Q9D1B9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl28Q9D1B9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl28Q9D1B9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl28Q9D1B9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl28Q9D1B9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl28Q9D1B9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl28Q9D1B9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl28Q9D1B9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl28Q9D1B9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl28Q9D1B9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl28Q9D1B9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl28Q9D1B9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl28Q9D1B9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl28Q9D1B9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl28Q9D1B9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl28Q9D1B9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl28Q9D1B9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl28Q9D1B9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl28Q9D1B9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl28Q9D1B9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrpl28Q9D1B9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl28Q9D1B9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl28Q9D1B9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl28Q9D1B9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl28Q9D1B9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl28Q9D1B9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl28Q9D1B9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl28Q9D1B9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl28Q9D1B9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl28Q9D1B9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl28Q9D1B9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl28Q9D1B9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl28Q9D1B9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl28Q9D1B9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl28Q9D1B9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl28Q9D1B9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl28Q9D1B9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl28Q9D1B9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl28Q9D1B9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl28Q9D1B9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl28Q9D1B9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl28Q9D1B9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl28Q9D1B9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl28Q9D1B9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl28Q9D1B9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl28Q9D1B9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl28Q9D1B9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl28Q9D1B9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl28Q9D1B9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl28Q9D1B9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl28Q9D1B9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl28Q9D1B9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl28Q9D1B9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl28Q9D1B9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl28Q9D1B9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms