Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZV8

Fbxl20, F-box/LRR-repeat protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl20Q9CZV8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fbxl20Q9CZV8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fbxl20Q9CZV8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fbxl20Q9CZV8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Fbxl20Q9CZV8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fbxl20Q9CZV8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbxl20Q9CZV8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fbxl20Q9CZV8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbxl20Q9CZV8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbxl20Q9CZV8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fbxl20Q9CZV8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbxl20Q9CZV8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fbxl20Q9CZV8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbxl20Q9CZV8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbxl20Q9CZV8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbxl20Q9CZV8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fbxl20Q9CZV8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fbxl20Q9CZV8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fbxl20Q9CZV8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fbxl20Q9CZV8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fbxl20Q9CZV8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbxl20Q9CZV8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fbxl20Q9CZV8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fbxl20Q9CZV8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fbxl20Q9CZV8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fbxl20Q9CZV8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fbxl20Q9CZV8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fbxl20Q9CZV8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fbxl20Q9CZV8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fbxl20Q9CZV8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fbxl20Q9CZV8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fbxl20Q9CZV8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fbxl20Q9CZV8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fbxl20Q9CZV8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fbxl20Q9CZV8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fbxl20Q9CZV8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fbxl20Q9CZV8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fbxl20Q9CZV8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbxl20Q9CZV8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fbxl20Q9CZV8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fbxl20Q9CZV8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbxl20Q9CZV8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fbxl20Q9CZV8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fbxl20Q9CZV8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fbxl20Q9CZV8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fbxl20Q9CZV8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fbxl20Q9CZV8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Fbxl20Q9CZV8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxl20Q9CZV8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxl20Q9CZV8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxl20Q9CZV8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbxl20Q9CZV8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbxl20Q9CZV8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxl20Q9CZV8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxl20Q9CZV8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxl20Q9CZV8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxl20Q9CZV8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxl20Q9CZV8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxl20Q9CZV8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxl20Q9CZV8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fbxl20Q9CZV8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxl20Q9CZV8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxl20Q9CZV8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxl20Q9CZV8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxl20Q9CZV8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxl20Q9CZV8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxl20Q9CZV8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxl20Q9CZV8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxl20Q9CZV8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxl20Q9CZV8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxl20Q9CZV8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxl20Q9CZV8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxl20Q9CZV8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxl20Q9CZV8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxl20Q9CZV8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxl20Q9CZV8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxl20Q9CZV8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxl20Q9CZV8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxl20Q9CZV8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxl20Q9CZV8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxl20Q9CZV8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxl20Q9CZV8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxl20Q9CZV8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxl20Q9CZV8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbxl20Q9CZV8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbxl20Q9CZV8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbxl20Q9CZV8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbxl20Q9CZV8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fbxl20Q9CZV8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fbxl20Q9CZV8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms