Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gins3Q9CY94 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gins3Q9CY94 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gins3Q9CY94 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gins3Q9CY94 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gins3Q9CY94 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gins3Q9CY94 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gins3Q9CY94 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gins3Q9CY94 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gins3Q9CY94 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gins3Q9CY94 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gins3Q9CY94 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins3Q9CY94 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gins3Q9CY94 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins3Q9CY94 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gins3Q9CY94 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gins3Q9CY94 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gins3Q9CY94 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gins3Q9CY94 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gins3Q9CY94 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gins3Q9CY94 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gins3Q9CY94 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gins3Q9CY94 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gins3Q9CY94 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gins3Q9CY94 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gins3Q9CY94 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gins3Q9CY94 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gins3Q9CY94 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gins3Q9CY94 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gins3Q9CY94 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gins3Q9CY94 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gins3Q9CY94 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gins3Q9CY94 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gins3Q9CY94 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gins3Q9CY94 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gins3Q9CY94 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gins3Q9CY94 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gins3Q9CY94 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gins3Q9CY94 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gins3Q9CY94 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gins3Q9CY94 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gins3Q9CY94 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gins3Q9CY94 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gins3Q9CY94 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gins3Q9CY94 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gins3Q9CY94 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gins3Q9CY94 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gins3Q9CY94 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gins3Q9CY94 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gins3Q9CY94 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gins3Q9CY94 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gins3Q9CY94 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gins3Q9CY94 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gins3Q9CY94 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gins3Q9CY94 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gins3Q9CY94 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gins3Q9CY94 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gins3Q9CY94 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gins3Q9CY94 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gins3Q9CY94 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gins3Q9CY94 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gins3Q9CY94 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gins3Q9CY94 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gins3Q9CY94 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gins3Q9CY94 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gins3Q9CY94 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gins3Q9CY94 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gins3Q9CY94 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gins3Q9CY94 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gins3Q9CY94 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gins3Q9CY94 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gins3Q9CY94 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins3Q9CY94 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins3Q9CY94 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gins3Q9CY94 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gins3Q9CY94 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins3Q9CY94 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins3Q9CY94 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gins3Q9CY94 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gins3Q9CY94 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gins3Q9CY94 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gins3Q9CY94 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gins3Q9CY94 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gins3Q9CY94 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gins3Q9CY94 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gins3Q9CY94 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gins3Q9CY94 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms