Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mrps28Q9CY16 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mrps28Q9CY16 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mrps28Q9CY16 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mrps28Q9CY16 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mrps28Q9CY16 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mrps28Q9CY16 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrps28Q9CY16 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mrps28Q9CY16 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrps28Q9CY16 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrps28Q9CY16 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrps28Q9CY16 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mrps28Q9CY16 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrps28Q9CY16 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrps28Q9CY16 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrps28Q9CY16 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrps28Q9CY16 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrps28Q9CY16 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrps28Q9CY16 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrps28Q9CY16 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrps28Q9CY16 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrps28Q9CY16 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrps28Q9CY16 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrps28Q9CY16 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrps28Q9CY16 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrps28Q9CY16 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrps28Q9CY16 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mrps28Q9CY16 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrps28Q9CY16 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrps28Q9CY16 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrps28Q9CY16 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mrps28Q9CY16 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mrps28Q9CY16 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mrps28Q9CY16 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrps28Q9CY16 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mrps28Q9CY16 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrps28Q9CY16 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrps28Q9CY16 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrps28Q9CY16 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrps28Q9CY16 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrps28Q9CY16 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrps28Q9CY16 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrps28Q9CY16 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrps28Q9CY16 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrps28Q9CY16 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrps28Q9CY16 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrps28Q9CY16 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrps28Q9CY16 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrps28Q9CY16 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrps28Q9CY16 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrps28Q9CY16 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrps28Q9CY16 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrps28Q9CY16 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrps28Q9CY16 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrps28Q9CY16 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrps28Q9CY16 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrps28Q9CY16 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrps28Q9CY16 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrps28Q9CY16 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrps28Q9CY16 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrps28Q9CY16 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrps28Q9CY16 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrps28Q9CY16 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrps28Q9CY16 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrps28Q9CY16 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrps28Q9CY16 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrps28Q9CY16 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mrps28Q9CY16 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrps28Q9CY16 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrps28Q9CY16 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrps28Q9CY16 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrps28Q9CY16 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrps28Q9CY16 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrps28Q9CY16 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrps28Q9CY16 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrps28Q9CY16 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrps28Q9CY16 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrps28Q9CY16 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrps28Q9CY16 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrps28Q9CY16 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrps28Q9CY16 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mrps28Q9CY16 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrps28Q9CY16 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrps28Q9CY16 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrps28Q9CY16 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrps28Q9CY16 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrps28Q9CY16 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mrps28Q9CY16 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mrps28Q9CY16 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrps28Q9CY16 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrps28Q9CY16 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrps28Q9CY16 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mrps28Q9CY16 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mrps28Q9CY16 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mrps28Q9CY16 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrps28Q9CY16 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrps28Q9CY16 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrps28Q9CY16 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrps28Q9CY16 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrps28Q9CY16 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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