Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl11Q9CXW4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl11Q9CXW4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl11Q9CXW4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl11Q9CXW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl11Q9CXW4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl11Q9CXW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl11Q9CXW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl11Q9CXW4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl11Q9CXW4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl11Q9CXW4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl11Q9CXW4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl11Q9CXW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl11Q9CXW4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl11Q9CXW4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl11Q9CXW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpl11Q9CXW4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpl11Q9CXW4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl11Q9CXW4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl11Q9CXW4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl11Q9CXW4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl11Q9CXW4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl11Q9CXW4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl11Q9CXW4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl11Q9CXW4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl11Q9CXW4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl11Q9CXW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl11Q9CXW4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl11Q9CXW4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl11Q9CXW4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl11Q9CXW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl11Q9CXW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl11Q9CXW4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpl11Q9CXW4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpl11Q9CXW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpl11Q9CXW4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpl11Q9CXW4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpl11Q9CXW4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rpl11Q9CXW4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rpl11Q9CXW4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl11Q9CXW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpl11Q9CXW4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl11Q9CXW4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl11Q9CXW4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl11Q9CXW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl11Q9CXW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl11Q9CXW4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl11Q9CXW4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl11Q9CXW4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl11Q9CXW4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl11Q9CXW4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl11Q9CXW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl11Q9CXW4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl11Q9CXW4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl11Q9CXW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl11Q9CXW4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl11Q9CXW4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl11Q9CXW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl11Q9CXW4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl11Q9CXW4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl11Q9CXW4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl11Q9CXW4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl11Q9CXW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl11Q9CXW4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpl11Q9CXW4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl11Q9CXW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl11Q9CXW4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl11Q9CXW4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl11Q9CXW4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl11Q9CXW4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl11Q9CXW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl11Q9CXW4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl11Q9CXW4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl11Q9CXW4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl11Q9CXW4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl11Q9CXW4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl11Q9CXW4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl11Q9CXW4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl11Q9CXW4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl11Q9CXW4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl11Q9CXW4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl11Q9CXW4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl11Q9CXW4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl11Q9CXW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl11Q9CXW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl11Q9CXW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl11Q9CXW4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms