Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Tmed5Q9CXE7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Tmed5Q9CXE7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Tmed5Q9CXE7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Tmed5Q9CXE7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Tmed5Q9CXE7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Tmed5Q9CXE7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Tmed5Q9CXE7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Tmed5Q9CXE7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Tmed5Q9CXE7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,47■■□□□ 1,83
Tmed5Q9CXE7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Tmed5Q9CXE7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tmed5Q9CXE7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Tmed5Q9CXE7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Tmed5Q9CXE7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Tmed5Q9CXE7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Tmed5Q9CXE7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Tmed5Q9CXE7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Tmed5Q9CXE7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Tmed5Q9CXE7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Tmed5Q9CXE7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Tmed5Q9CXE7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tmed5Q9CXE7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Tmed5Q9CXE7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tmed5Q9CXE7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tmed5Q9CXE7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Tmed5Q9CXE7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Tmed5Q9CXE7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tmed5Q9CXE7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Tmed5Q9CXE7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tmed5Q9CXE7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tmed5Q9CXE7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Tmed5Q9CXE7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Tmed5Q9CXE7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Tmed5Q9CXE7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Tmed5Q9CXE7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Tmed5Q9CXE7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Tmed5Q9CXE7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
Tmed5Q9CXE7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Tmed5Q9CXE7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Tmed5Q9CXE7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Tmed5Q9CXE7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Tmed5Q9CXE7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Tmed5Q9CXE7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tmed5Q9CXE7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tmed5Q9CXE7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tmed5Q9CXE7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tmed5Q9CXE7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Tmed5Q9CXE7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Tmed5Q9CXE7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Tmed5Q9CXE7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tmed5Q9CXE7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tmed5Q9CXE7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,7■■□□□ 1,71
Tmed5Q9CXE7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Tmed5Q9CXE7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Tmed5Q9CXE7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Tmed5Q9CXE7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Tmed5Q9CXE7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tmed5Q9CXE7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tmed5Q9CXE7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Tmed5Q9CXE7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Tmed5Q9CXE7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tmed5Q9CXE7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Tmed5Q9CXE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Tmed5Q9CXE7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Tmed5Q9CXE7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tmed5Q9CXE7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tmed5Q9CXE7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Tmed5Q9CXE7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Tmed5Q9CXE7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Tmed5Q9CXE7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Tmed5Q9CXE7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Tmed5Q9CXE7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Tmed5Q9CXE7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tmed5Q9CXE7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Tmed5Q9CXE7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Tmed5Q9CXE7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Tmed5Q9CXE7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Tmed5Q9CXE7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Tmed5Q9CXE7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Tmed5Q9CXE7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tmed5Q9CXE7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tmed5Q9CXE7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Tmed5Q9CXE7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Tmed5Q9CXE7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Tmed5Q9CXE7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Tmed5Q9CXE7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms