Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Malsu1Q9CWV0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Malsu1Q9CWV0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Malsu1Q9CWV0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Malsu1Q9CWV0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Malsu1Q9CWV0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Malsu1Q9CWV0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Malsu1Q9CWV0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Malsu1Q9CWV0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Malsu1Q9CWV0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Malsu1Q9CWV0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Malsu1Q9CWV0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Malsu1Q9CWV0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Malsu1Q9CWV0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Malsu1Q9CWV0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Malsu1Q9CWV0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Malsu1Q9CWV0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Malsu1Q9CWV0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Malsu1Q9CWV0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Malsu1Q9CWV0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Malsu1Q9CWV0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Malsu1Q9CWV0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Malsu1Q9CWV0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Malsu1Q9CWV0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Malsu1Q9CWV0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Malsu1Q9CWV0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Malsu1Q9CWV0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Malsu1Q9CWV0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Malsu1Q9CWV0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Malsu1Q9CWV0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Malsu1Q9CWV0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Malsu1Q9CWV0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Malsu1Q9CWV0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Malsu1Q9CWV0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Malsu1Q9CWV0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Malsu1Q9CWV0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Malsu1Q9CWV0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Malsu1Q9CWV0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Malsu1Q9CWV0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Malsu1Q9CWV0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Malsu1Q9CWV0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Malsu1Q9CWV0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Malsu1Q9CWV0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Malsu1Q9CWV0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Malsu1Q9CWV0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Malsu1Q9CWV0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Malsu1Q9CWV0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Malsu1Q9CWV0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Malsu1Q9CWV0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Malsu1Q9CWV0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Malsu1Q9CWV0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Malsu1Q9CWV0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Malsu1Q9CWV0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Malsu1Q9CWV0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Malsu1Q9CWV0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Malsu1Q9CWV0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Malsu1Q9CWV0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Malsu1Q9CWV0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Malsu1Q9CWV0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Malsu1Q9CWV0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Malsu1Q9CWV0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Malsu1Q9CWV0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Malsu1Q9CWV0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Malsu1Q9CWV0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Malsu1Q9CWV0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Malsu1Q9CWV0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Malsu1Q9CWV0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Malsu1Q9CWV0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Malsu1Q9CWV0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Malsu1Q9CWV0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Malsu1Q9CWV0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Malsu1Q9CWV0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Malsu1Q9CWV0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Malsu1Q9CWV0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Malsu1Q9CWV0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Malsu1Q9CWV0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Malsu1Q9CWV0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Malsu1Q9CWV0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Malsu1Q9CWV0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Malsu1Q9CWV0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Malsu1Q9CWV0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Malsu1Q9CWV0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Malsu1Q9CWV0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Malsu1Q9CWV0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms