Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc96Q9CR92 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc96Q9CR92 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc96Q9CR92 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc96Q9CR92 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc96Q9CR92 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc96Q9CR92 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc96Q9CR92 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc96Q9CR92 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc96Q9CR92 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc96Q9CR92 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc96Q9CR92 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc96Q9CR92 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc96Q9CR92 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc96Q9CR92 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc96Q9CR92 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc96Q9CR92 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc96Q9CR92 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc96Q9CR92 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc96Q9CR92 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc96Q9CR92 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc96Q9CR92 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc96Q9CR92 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc96Q9CR92 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc96Q9CR92 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccdc96Q9CR92 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc96Q9CR92 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc96Q9CR92 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc96Q9CR92 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc96Q9CR92 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc96Q9CR92 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc96Q9CR92 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc96Q9CR92 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc96Q9CR92 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc96Q9CR92 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc96Q9CR92 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc96Q9CR92 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc96Q9CR92 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc96Q9CR92 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc96Q9CR92 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc96Q9CR92 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc96Q9CR92 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc96Q9CR92 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc96Q9CR92 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc96Q9CR92 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc96Q9CR92 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc96Q9CR92 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc96Q9CR92 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc96Q9CR92 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc96Q9CR92 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc96Q9CR92 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc96Q9CR92 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc96Q9CR92 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc96Q9CR92 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc96Q9CR92 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc96Q9CR92 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc96Q9CR92 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc96Q9CR92 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc96Q9CR92 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc96Q9CR92 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc96Q9CR92 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc96Q9CR92 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc96Q9CR92 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc96Q9CR92 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc96Q9CR92 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc96Q9CR92 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc96Q9CR92 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc96Q9CR92 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc96Q9CR92 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc96Q9CR92 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc96Q9CR92 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc96Q9CR92 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc96Q9CR92 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc96Q9CR92 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc96Q9CR92 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc96Q9CR92 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc96Q9CR92 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc96Q9CR92 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc96Q9CR92 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc96Q9CR92 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc96Q9CR92 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc96Q9CR92 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc96Q9CR92 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc96Q9CR92 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc96Q9CR92 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc96Q9CR92 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms