Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Riok2Q9CQS5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Riok2Q9CQS5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Riok2Q9CQS5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Riok2Q9CQS5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Riok2Q9CQS5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Riok2Q9CQS5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Riok2Q9CQS5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Riok2Q9CQS5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Riok2Q9CQS5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Riok2Q9CQS5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Riok2Q9CQS5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Riok2Q9CQS5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Riok2Q9CQS5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Riok2Q9CQS5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Riok2Q9CQS5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Riok2Q9CQS5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Riok2Q9CQS5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Riok2Q9CQS5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok2Q9CQS5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Riok2Q9CQS5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Riok2Q9CQS5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Riok2Q9CQS5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Riok2Q9CQS5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Riok2Q9CQS5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Riok2Q9CQS5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Riok2Q9CQS5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Riok2Q9CQS5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Riok2Q9CQS5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Riok2Q9CQS5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Riok2Q9CQS5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok2Q9CQS5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok2Q9CQS5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok2Q9CQS5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok2Q9CQS5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok2Q9CQS5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Riok2Q9CQS5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Riok2Q9CQS5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok2Q9CQS5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Riok2Q9CQS5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok2Q9CQS5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok2Q9CQS5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Riok2Q9CQS5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Riok2Q9CQS5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Riok2Q9CQS5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok2Q9CQS5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok2Q9CQS5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok2Q9CQS5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Riok2Q9CQS5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Riok2Q9CQS5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riok2Q9CQS5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Riok2Q9CQS5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Riok2Q9CQS5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Riok2Q9CQS5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Riok2Q9CQS5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Riok2Q9CQS5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Riok2Q9CQS5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Riok2Q9CQS5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Riok2Q9CQS5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Riok2Q9CQS5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Riok2Q9CQS5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Riok2Q9CQS5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Riok2Q9CQS5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Riok2Q9CQS5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Riok2Q9CQS5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Riok2Q9CQS5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Riok2Q9CQS5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Riok2Q9CQS5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Riok2Q9CQS5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Riok2Q9CQS5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riok2Q9CQS5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riok2Q9CQS5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Riok2Q9CQS5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riok2Q9CQS5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riok2Q9CQS5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Riok2Q9CQS5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Riok2Q9CQS5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Riok2Q9CQS5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Riok2Q9CQS5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Riok2Q9CQS5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Riok2Q9CQS5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riok2Q9CQS5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Riok2Q9CQS5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Riok2Q9CQS5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Riok2Q9CQS5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riok2Q9CQS5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Riok2Q9CQS5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Riok2Q9CQS5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Riok2Q9CQS5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riok2Q9CQS5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Riok2Q9CQS5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Riok2Q9CQS5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Riok2Q9CQS5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Riok2Q9CQS5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Riok2Q9CQS5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Riok2Q9CQS5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riok2Q9CQS5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Riok2Q9CQS5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riok2Q9CQS5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Riok2Q9CQS5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms