Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nicn1Q9CQM0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nicn1Q9CQM0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nicn1Q9CQM0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nicn1Q9CQM0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nicn1Q9CQM0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nicn1Q9CQM0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nicn1Q9CQM0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nicn1Q9CQM0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nicn1Q9CQM0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nicn1Q9CQM0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nicn1Q9CQM0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nicn1Q9CQM0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nicn1Q9CQM0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nicn1Q9CQM0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nicn1Q9CQM0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nicn1Q9CQM0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nicn1Q9CQM0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nicn1Q9CQM0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nicn1Q9CQM0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nicn1Q9CQM0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nicn1Q9CQM0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nicn1Q9CQM0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nicn1Q9CQM0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nicn1Q9CQM0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nicn1Q9CQM0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nicn1Q9CQM0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nicn1Q9CQM0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nicn1Q9CQM0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nicn1Q9CQM0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nicn1Q9CQM0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nicn1Q9CQM0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nicn1Q9CQM0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nicn1Q9CQM0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nicn1Q9CQM0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nicn1Q9CQM0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nicn1Q9CQM0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nicn1Q9CQM0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nicn1Q9CQM0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nicn1Q9CQM0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nicn1Q9CQM0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nicn1Q9CQM0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nicn1Q9CQM0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nicn1Q9CQM0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nicn1Q9CQM0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nicn1Q9CQM0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nicn1Q9CQM0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nicn1Q9CQM0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nicn1Q9CQM0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nicn1Q9CQM0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nicn1Q9CQM0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nicn1Q9CQM0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nicn1Q9CQM0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nicn1Q9CQM0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nicn1Q9CQM0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nicn1Q9CQM0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nicn1Q9CQM0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nicn1Q9CQM0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nicn1Q9CQM0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nicn1Q9CQM0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nicn1Q9CQM0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nicn1Q9CQM0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nicn1Q9CQM0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nicn1Q9CQM0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nicn1Q9CQM0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nicn1Q9CQM0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nicn1Q9CQM0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nicn1Q9CQM0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nicn1Q9CQM0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nicn1Q9CQM0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nicn1Q9CQM0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nicn1Q9CQM0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nicn1Q9CQM0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nicn1Q9CQM0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nicn1Q9CQM0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nicn1Q9CQM0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nicn1Q9CQM0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nicn1Q9CQM0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nicn1Q9CQM0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nicn1Q9CQM0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nicn1Q9CQM0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nicn1Q9CQM0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nicn1Q9CQM0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nicn1Q9CQM0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nicn1Q9CQM0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms