Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI6

Cotl1, Coactosin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cotl1Q9CQI6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Cotl1Q9CQI6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cotl1Q9CQI6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cotl1Q9CQI6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cotl1Q9CQI6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Cotl1Q9CQI6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Cotl1Q9CQI6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cotl1Q9CQI6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Cotl1Q9CQI6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Cotl1Q9CQI6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cotl1Q9CQI6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Cotl1Q9CQI6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Cotl1Q9CQI6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Cotl1Q9CQI6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cotl1Q9CQI6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Cotl1Q9CQI6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Cotl1Q9CQI6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Cotl1Q9CQI6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Cotl1Q9CQI6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cotl1Q9CQI6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Cotl1Q9CQI6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Cotl1Q9CQI6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Cotl1Q9CQI6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Cotl1Q9CQI6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Cotl1Q9CQI6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Cotl1Q9CQI6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Cotl1Q9CQI6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Cotl1Q9CQI6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Cotl1Q9CQI6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Cotl1Q9CQI6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Cotl1Q9CQI6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Cotl1Q9CQI6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Cotl1Q9CQI6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Cotl1Q9CQI6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cotl1Q9CQI6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cotl1Q9CQI6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cotl1Q9CQI6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Cotl1Q9CQI6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cotl1Q9CQI6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,41■□□□□ 0,86
Cotl1Q9CQI6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Cotl1Q9CQI6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Cotl1Q9CQI6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Cotl1Q9CQI6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Cotl1Q9CQI6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Cotl1Q9CQI6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Cotl1Q9CQI6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Cotl1Q9CQI6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Cotl1Q9CQI6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Cotl1Q9CQI6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Cotl1Q9CQI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Cotl1Q9CQI6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Cotl1Q9CQI6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Cotl1Q9CQI6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Cotl1Q9CQI6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Cotl1Q9CQI6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20,26■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20,26■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,22■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Cotl1Q9CQI6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,18■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Cotl1Q9CQI6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Cotl1Q9CQI6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Cotl1Q9CQI6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Cotl1Q9CQI6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,12■□□□□ 0,81
Cotl1Q9CQI6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Cotl1Q9CQI6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Cotl1Q9CQI6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Cotl1Q9CQI6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cotl1Q9CQI6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cotl1Q9CQI6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cotl1Q9CQI6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cotl1Q9CQI6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cotl1Q9CQI6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Cotl1Q9CQI6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Cotl1Q9CQI6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Cotl1Q9CQI6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,79
Cotl1Q9CQI6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Cotl1Q9CQI6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20■□□□□ 0,79
Cotl1Q9CQI6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Cotl1Q9CQI6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cotl1Q9CQI6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cotl1Q9CQI6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms