Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrrc18Q9CQ07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrrc18Q9CQ07 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Lrrc18Q9CQ07 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Lrrc18Q9CQ07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Lrrc18Q9CQ07 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Lrrc18Q9CQ07 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Lrrc18Q9CQ07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Lrrc18Q9CQ07 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Lrrc18Q9CQ07 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Lrrc18Q9CQ07 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Lrrc18Q9CQ07 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Lrrc18Q9CQ07 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Lrrc18Q9CQ07 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Lrrc18Q9CQ07 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Lrrc18Q9CQ07 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Lrrc18Q9CQ07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Lrrc18Q9CQ07 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Lrrc18Q9CQ07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Lrrc18Q9CQ07 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Lrrc18Q9CQ07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Lrrc18Q9CQ07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Lrrc18Q9CQ07 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Lrrc18Q9CQ07 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Lrrc18Q9CQ07 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Lrrc18Q9CQ07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Lrrc18Q9CQ07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Lrrc18Q9CQ07 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
Lrrc18Q9CQ07 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Lrrc18Q9CQ07 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Lrrc18Q9CQ07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Lrrc18Q9CQ07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Lrrc18Q9CQ07 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Lrrc18Q9CQ07 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Lrrc18Q9CQ07 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Lrrc18Q9CQ07 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Lrrc18Q9CQ07 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Lrrc18Q9CQ07 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Lrrc18Q9CQ07 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Lrrc18Q9CQ07 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Lrrc18Q9CQ07 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Lrrc18Q9CQ07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Lrrc18Q9CQ07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Lrrc18Q9CQ07 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Lrrc18Q9CQ07 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Lrrc18Q9CQ07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Lrrc18Q9CQ07 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Lrrc18Q9CQ07 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Lrrc18Q9CQ07 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Lrrc18Q9CQ07 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Lrrc18Q9CQ07 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Lrrc18Q9CQ07 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Lrrc18Q9CQ07 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Lrrc18Q9CQ07 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Lrrc18Q9CQ07 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Lrrc18Q9CQ07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Lrrc18Q9CQ07 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Lrrc18Q9CQ07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Lrrc18Q9CQ07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Lrrc18Q9CQ07 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Lrrc18Q9CQ07 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Lrrc18Q9CQ07 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Lrrc18Q9CQ07 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Lrrc18Q9CQ07 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Lrrc18Q9CQ07 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Lrrc18Q9CQ07 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Lrrc18Q9CQ07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Lrrc18Q9CQ07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Lrrc18Q9CQ07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,34■■□□□ 1,49
Lrrc18Q9CQ07 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Lrrc18Q9CQ07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Lrrc18Q9CQ07 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Lrrc18Q9CQ07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Lrrc18Q9CQ07 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Lrrc18Q9CQ07 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Lrrc18Q9CQ07 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Lrrc18Q9CQ07 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Lrrc18Q9CQ07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Lrrc18Q9CQ07 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Lrrc18Q9CQ07 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Lrrc18Q9CQ07 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
Lrrc18Q9CQ07 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Lrrc18Q9CQ07 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Lrrc18Q9CQ07 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Lrrc18Q9CQ07 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Lrrc18Q9CQ07 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,2■■□□□ 1,46
Lrrc18Q9CQ07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Lrrc18Q9CQ07 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Lrrc18Q9CQ07 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
Lrrc18Q9CQ07 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Lrrc18Q9CQ07 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Lrrc18Q9CQ07 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Lrrc18Q9CQ07 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Lrrc18Q9CQ07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Lrrc18Q9CQ07 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,44
Lrrc18Q9CQ07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms