Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc18Q9CQ07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc18Q9CQ07 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc18Q9CQ07 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc18Q9CQ07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc18Q9CQ07 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc18Q9CQ07 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc18Q9CQ07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc18Q9CQ07 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc18Q9CQ07 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc18Q9CQ07 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc18Q9CQ07 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc18Q9CQ07 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc18Q9CQ07 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc18Q9CQ07 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc18Q9CQ07 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc18Q9CQ07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc18Q9CQ07 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc18Q9CQ07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc18Q9CQ07 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc18Q9CQ07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc18Q9CQ07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc18Q9CQ07 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc18Q9CQ07 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc18Q9CQ07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc18Q9CQ07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc18Q9CQ07 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc18Q9CQ07 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc18Q9CQ07 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc18Q9CQ07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc18Q9CQ07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc18Q9CQ07 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc18Q9CQ07 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrrc18Q9CQ07 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc18Q9CQ07 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc18Q9CQ07 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc18Q9CQ07 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc18Q9CQ07 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc18Q9CQ07 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc18Q9CQ07 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc18Q9CQ07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc18Q9CQ07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc18Q9CQ07 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc18Q9CQ07 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc18Q9CQ07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc18Q9CQ07 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc18Q9CQ07 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc18Q9CQ07 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc18Q9CQ07 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc18Q9CQ07 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc18Q9CQ07 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc18Q9CQ07 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc18Q9CQ07 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc18Q9CQ07 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc18Q9CQ07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc18Q9CQ07 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc18Q9CQ07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc18Q9CQ07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc18Q9CQ07 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc18Q9CQ07 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc18Q9CQ07 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc18Q9CQ07 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc18Q9CQ07 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc18Q9CQ07 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc18Q9CQ07 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc18Q9CQ07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc18Q9CQ07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc18Q9CQ07 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc18Q9CQ07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc18Q9CQ07 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc18Q9CQ07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc18Q9CQ07 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc18Q9CQ07 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc18Q9CQ07 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc18Q9CQ07 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc18Q9CQ07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc18Q9CQ07 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc18Q9CQ07 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc18Q9CQ07 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc18Q9CQ07 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc18Q9CQ07 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc18Q9CQ07 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc18Q9CQ07 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc18Q9CQ07 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc18Q9CQ07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc18Q9CQ07 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc18Q9CQ07 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc18Q9CQ07 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc18Q9CQ07 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc18Q9CQ07 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc18Q9CQ07 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc18Q9CQ07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc18Q9CQ07 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrc18Q9CQ07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms