Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cadm3Q99N28 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cadm3Q99N28 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cadm3Q99N28 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cadm3Q99N28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cadm3Q99N28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cadm3Q99N28 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cadm3Q99N28 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cadm3Q99N28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cadm3Q99N28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cadm3Q99N28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cadm3Q99N28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cadm3Q99N28 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cadm3Q99N28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cadm3Q99N28 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cadm3Q99N28 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cadm3Q99N28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cadm3Q99N28 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cadm3Q99N28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cadm3Q99N28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cadm3Q99N28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cadm3Q99N28 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cadm3Q99N28 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cadm3Q99N28 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cadm3Q99N28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cadm3Q99N28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cadm3Q99N28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cadm3Q99N28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cadm3Q99N28 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cadm3Q99N28 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cadm3Q99N28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cadm3Q99N28 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cadm3Q99N28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cadm3Q99N28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cadm3Q99N28 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cadm3Q99N28 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cadm3Q99N28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cadm3Q99N28 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cadm3Q99N28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cadm3Q99N28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cadm3Q99N28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cadm3Q99N28 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cadm3Q99N28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cadm3Q99N28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cadm3Q99N28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cadm3Q99N28 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cadm3Q99N28 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cadm3Q99N28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cadm3Q99N28 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cadm3Q99N28 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cadm3Q99N28 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cadm3Q99N28 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cadm3Q99N28 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cadm3Q99N28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cadm3Q99N28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cadm3Q99N28 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cadm3Q99N28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cadm3Q99N28 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cadm3Q99N28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cadm3Q99N28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cadm3Q99N28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cadm3Q99N28 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cadm3Q99N28 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cadm3Q99N28 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cadm3Q99N28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cadm3Q99N28 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cadm3Q99N28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cadm3Q99N28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cadm3Q99N28 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cadm3Q99N28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cadm3Q99N28 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cadm3Q99N28 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cadm3Q99N28 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cadm3Q99N28 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cadm3Q99N28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cadm3Q99N28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cadm3Q99N28 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cadm3Q99N28 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cadm3Q99N28 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms