Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a8Q99N10 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a8Q99N10 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ms4a8Q99N10 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a8Q99N10 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a8Q99N10 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a8Q99N10 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a8Q99N10 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ms4a8Q99N10 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a8Q99N10 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a8Q99N10 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a8Q99N10 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ms4a8Q99N10 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a8Q99N10 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a8Q99N10 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a8Q99N10 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a8Q99N10 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a8Q99N10 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a8Q99N10 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ms4a8Q99N10 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a8Q99N10 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a8Q99N10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a8Q99N10 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a8Q99N10 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a8Q99N10 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a8Q99N10 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a8Q99N10 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a8Q99N10 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a8Q99N10 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a8Q99N10 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a8Q99N10 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a8Q99N10 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a8Q99N10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a8Q99N10 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a8Q99N10 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a8Q99N10 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a8Q99N10 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a8Q99N10 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a8Q99N10 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a8Q99N10 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a8Q99N10 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a8Q99N10 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a8Q99N10 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a8Q99N10 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a8Q99N10 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a8Q99N10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a8Q99N10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a8Q99N10 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a8Q99N10 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a8Q99N10 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ms4a8Q99N10 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a8Q99N10 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a8Q99N10 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a8Q99N10 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a8Q99N10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a8Q99N10 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a8Q99N10 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a8Q99N10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a8Q99N10 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a8Q99N10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a8Q99N10 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a8Q99N10 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a8Q99N10 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a8Q99N10 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a8Q99N10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a8Q99N10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a8Q99N10 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a8Q99N10 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a8Q99N10 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a8Q99N10 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ms4a8Q99N10 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a8Q99N10 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a8Q99N10 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a8Q99N10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a8Q99N10 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a8Q99N10 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a8Q99N10 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a8Q99N10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a8Q99N10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a8Q99N10 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a8Q99N10 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ms4a8Q99N10 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ms4a8Q99N10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ms4a8Q99N10 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a8Q99N10 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a8Q99N10 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ms4a8Q99N10 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ms4a8Q99N10 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a8Q99N10 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a8Q99N10 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a8Q99N10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a8Q99N10 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a8Q99N10 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a8Q99N10 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ms4a8Q99N10 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a8Q99N10 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a8Q99N10 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ms4a8Q99N10 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ms4a8Q99N10 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ms4a8Q99N10 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms