Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CalcbQ99MP3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CalcbQ99MP3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CalcbQ99MP3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CalcbQ99MP3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CalcbQ99MP3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CalcbQ99MP3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CalcbQ99MP3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CalcbQ99MP3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CalcbQ99MP3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CalcbQ99MP3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CalcbQ99MP3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CalcbQ99MP3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CalcbQ99MP3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CalcbQ99MP3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CalcbQ99MP3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CalcbQ99MP3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CalcbQ99MP3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CalcbQ99MP3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CalcbQ99MP3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CalcbQ99MP3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CalcbQ99MP3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CalcbQ99MP3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CalcbQ99MP3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CalcbQ99MP3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CalcbQ99MP3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CalcbQ99MP3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CalcbQ99MP3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CalcbQ99MP3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CalcbQ99MP3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CalcbQ99MP3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CalcbQ99MP3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CalcbQ99MP3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CalcbQ99MP3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CalcbQ99MP3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CalcbQ99MP3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CalcbQ99MP3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CalcbQ99MP3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CalcbQ99MP3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CalcbQ99MP3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CalcbQ99MP3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CalcbQ99MP3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CalcbQ99MP3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CalcbQ99MP3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CalcbQ99MP3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CalcbQ99MP3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CalcbQ99MP3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CalcbQ99MP3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CalcbQ99MP3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CalcbQ99MP3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CalcbQ99MP3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CalcbQ99MP3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CalcbQ99MP3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CalcbQ99MP3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CalcbQ99MP3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CalcbQ99MP3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CalcbQ99MP3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CalcbQ99MP3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CalcbQ99MP3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CalcbQ99MP3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CalcbQ99MP3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CalcbQ99MP3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CalcbQ99MP3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CalcbQ99MP3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CalcbQ99MP3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CalcbQ99MP3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CalcbQ99MP3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CalcbQ99MP3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CalcbQ99MP3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CalcbQ99MP3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CalcbQ99MP3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CalcbQ99MP3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CalcbQ99MP3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CalcbQ99MP3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CalcbQ99MP3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CalcbQ99MP3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CalcbQ99MP3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CalcbQ99MP3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CalcbQ99MP3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CalcbQ99MP3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CalcbQ99MP3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CalcbQ99MP3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CalcbQ99MP3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CalcbQ99MP3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CalcbQ99MP3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CalcbQ99MP3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CalcbQ99MP3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CalcbQ99MP3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CalcbQ99MP3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CalcbQ99MP3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CalcbQ99MP3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CalcbQ99MP3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CalcbQ99MP3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CalcbQ99MP3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CalcbQ99MP3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CalcbQ99MP3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CalcbQ99MP3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CalcbQ99MP3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CalcbQ99MP3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CalcbQ99MP3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1369.6 ms