Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rnf34Q99KR6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rnf34Q99KR6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rnf34Q99KR6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf34Q99KR6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf34Q99KR6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf34Q99KR6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnf34Q99KR6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnf34Q99KR6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnf34Q99KR6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf34Q99KR6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnf34Q99KR6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf34Q99KR6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf34Q99KR6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf34Q99KR6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf34Q99KR6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf34Q99KR6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf34Q99KR6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rnf34Q99KR6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf34Q99KR6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Rnf34Q99KR6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf34Q99KR6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf34Q99KR6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf34Q99KR6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf34Q99KR6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnf34Q99KR6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rnf34Q99KR6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf34Q99KR6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf34Q99KR6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf34Q99KR6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf34Q99KR6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rnf34Q99KR6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf34Q99KR6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf34Q99KR6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rnf34Q99KR6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rnf34Q99KR6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf34Q99KR6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf34Q99KR6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf34Q99KR6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnf34Q99KR6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf34Q99KR6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rnf34Q99KR6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rnf34Q99KR6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rnf34Q99KR6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rnf34Q99KR6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rnf34Q99KR6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rnf34Q99KR6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rnf34Q99KR6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf34Q99KR6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rnf34Q99KR6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf34Q99KR6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf34Q99KR6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnf34Q99KR6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf34Q99KR6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf34Q99KR6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf34Q99KR6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnf34Q99KR6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf34Q99KR6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rnf34Q99KR6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf34Q99KR6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf34Q99KR6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf34Q99KR6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf34Q99KR6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf34Q99KR6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf34Q99KR6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf34Q99KR6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf34Q99KR6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf34Q99KR6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf34Q99KR6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf34Q99KR6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf34Q99KR6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf34Q99KR6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf34Q99KR6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf34Q99KR6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf34Q99KR6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf34Q99KR6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf34Q99KR6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf34Q99KR6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf34Q99KR6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf34Q99KR6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf34Q99KR6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf34Q99KR6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf34Q99KR6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf34Q99KR6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf34Q99KR6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf34Q99KR6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf34Q99KR6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf34Q99KR6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf34Q99KR6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnf34Q99KR6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms