Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dctn2Q99KJ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dctn2Q99KJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dctn2Q99KJ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dctn2Q99KJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dctn2Q99KJ8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dctn2Q99KJ8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn2Q99KJ8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dctn2Q99KJ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dctn2Q99KJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dctn2Q99KJ8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dctn2Q99KJ8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dctn2Q99KJ8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dctn2Q99KJ8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dctn2Q99KJ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dctn2Q99KJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dctn2Q99KJ8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dctn2Q99KJ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dctn2Q99KJ8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dctn2Q99KJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dctn2Q99KJ8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dctn2Q99KJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dctn2Q99KJ8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dctn2Q99KJ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dctn2Q99KJ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dctn2Q99KJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dctn2Q99KJ8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dctn2Q99KJ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dctn2Q99KJ8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dctn2Q99KJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dctn2Q99KJ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dctn2Q99KJ8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dctn2Q99KJ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dctn2Q99KJ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn2Q99KJ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn2Q99KJ8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn2Q99KJ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dctn2Q99KJ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dctn2Q99KJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dctn2Q99KJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dctn2Q99KJ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dctn2Q99KJ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dctn2Q99KJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dctn2Q99KJ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dctn2Q99KJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn2Q99KJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn2Q99KJ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn2Q99KJ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dctn2Q99KJ8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dctn2Q99KJ8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dctn2Q99KJ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dctn2Q99KJ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dctn2Q99KJ8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dctn2Q99KJ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn2Q99KJ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dctn2Q99KJ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dctn2Q99KJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dctn2Q99KJ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dctn2Q99KJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dctn2Q99KJ8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn2Q99KJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dctn2Q99KJ8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dctn2Q99KJ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dctn2Q99KJ8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dctn2Q99KJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dctn2Q99KJ8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dctn2Q99KJ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn2Q99KJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn2Q99KJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn2Q99KJ8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dctn2Q99KJ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dctn2Q99KJ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dctn2Q99KJ8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dctn2Q99KJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dctn2Q99KJ8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dctn2Q99KJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Dctn2Q99KJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dctn2Q99KJ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dctn2Q99KJ8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Dctn2Q99KJ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms