Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX4

Eif3m, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3mQ99JX4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Eif3mQ99JX4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Eif3mQ99JX4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Eif3mQ99JX4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Eif3mQ99JX4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Eif3mQ99JX4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Eif3mQ99JX4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Eif3mQ99JX4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Eif3mQ99JX4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Eif3mQ99JX4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Eif3mQ99JX4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Eif3mQ99JX4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Eif3mQ99JX4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Eif3mQ99JX4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Eif3mQ99JX4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Eif3mQ99JX4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Eif3mQ99JX4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Eif3mQ99JX4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Eif3mQ99JX4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Eif3mQ99JX4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Eif3mQ99JX4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Eif3mQ99JX4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Eif3mQ99JX4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Eif3mQ99JX4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Eif3mQ99JX4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Eif3mQ99JX4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Eif3mQ99JX4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Eif3mQ99JX4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Eif3mQ99JX4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Eif3mQ99JX4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Eif3mQ99JX4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Eif3mQ99JX4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Eif3mQ99JX4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Eif3mQ99JX4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Eif3mQ99JX4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Eif3mQ99JX4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Eif3mQ99JX4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Eif3mQ99JX4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Eif3mQ99JX4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Eif3mQ99JX4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Eif3mQ99JX4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Eif3mQ99JX4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Eif3mQ99JX4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Eif3mQ99JX4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Eif3mQ99JX4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Eif3mQ99JX4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Eif3mQ99JX4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Eif3mQ99JX4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
Eif3mQ99JX4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Eif3mQ99JX4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Eif3mQ99JX4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Eif3mQ99JX4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Eif3mQ99JX4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Eif3mQ99JX4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Eif3mQ99JX4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Eif3mQ99JX4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Eif3mQ99JX4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Eif3mQ99JX4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Eif3mQ99JX4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Eif3mQ99JX4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Eif3mQ99JX4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Eif3mQ99JX4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Eif3mQ99JX4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Eif3mQ99JX4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,83■■□□□ 1,56
Eif3mQ99JX4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,56
Eif3mQ99JX4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Eif3mQ99JX4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Eif3mQ99JX4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Eif3mQ99JX4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Eif3mQ99JX4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Eif3mQ99JX4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Eif3mQ99JX4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Eif3mQ99JX4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Eif3mQ99JX4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Eif3mQ99JX4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Eif3mQ99JX4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Eif3mQ99JX4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Eif3mQ99JX4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Eif3mQ99JX4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Eif3mQ99JX4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Eif3mQ99JX4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Eif3mQ99JX4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Eif3mQ99JX4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Eif3mQ99JX4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Eif3mQ99JX4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Eif3mQ99JX4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Eif3mQ99JX4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Eif3mQ99JX4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,9 ms