Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo1Q924W9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmo1Q924W9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmo1Q924W9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmo1Q924W9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmo1Q924W9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmo1Q924W9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmo1Q924W9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo1Q924W9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmo1Q924W9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmo1Q924W9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo1Q924W9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmo1Q924W9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo1Q924W9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo1Q924W9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo1Q924W9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo1Q924W9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo1Q924W9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo1Q924W9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo1Q924W9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo1Q924W9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo1Q924W9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo1Q924W9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo1Q924W9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo1Q924W9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo1Q924W9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmo1Q924W9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmo1Q924W9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo1Q924W9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo1Q924W9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo1Q924W9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo1Q924W9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo1Q924W9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo1Q924W9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo1Q924W9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmo1Q924W9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo1Q924W9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo1Q924W9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo1Q924W9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo1Q924W9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo1Q924W9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo1Q924W9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmo1Q924W9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmo1Q924W9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmo1Q924W9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmo1Q924W9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmo1Q924W9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo1Q924W9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo1Q924W9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo1Q924W9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo1Q924W9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmo1Q924W9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmo1Q924W9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmo1Q924W9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmo1Q924W9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo1Q924W9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmo1Q924W9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmo1Q924W9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo1Q924W9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmo1Q924W9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo1Q924W9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmo1Q924W9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmo1Q924W9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo1Q924W9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmo1Q924W9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo1Q924W9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo1Q924W9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmo1Q924W9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo1Q924W9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo1Q924W9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo1Q924W9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo1Q924W9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo1Q924W9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmo1Q924W9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmo1Q924W9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo1Q924W9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmo1Q924W9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo1Q924W9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmo1Q924W9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmo1Q924W9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmo1Q924W9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmo1Q924W9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmo1Q924W9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo1Q924W9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo1Q924W9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo1Q924W9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo1Q924W9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmo1Q924W9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo1Q924W9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmo1Q924W9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo1Q924W9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmo1Q924W9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmo1Q924W9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmo1Q924W9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmo1Q924W9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmo1Q924W9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmo1Q924W9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmo1Q924W9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmo1Q924W9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmo1Q924W9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms