Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Lrrc49Q91YK0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Lrrc49Q91YK0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
Lrrc49Q91YK0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Lrrc49Q91YK0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Lrrc49Q91YK0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Lrrc49Q91YK0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Lrrc49Q91YK0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Lrrc49Q91YK0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Lrrc49Q91YK0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Lrrc49Q91YK0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Lrrc49Q91YK0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Lrrc49Q91YK0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Lrrc49Q91YK0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Lrrc49Q91YK0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Lrrc49Q91YK0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Lrrc49Q91YK0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Lrrc49Q91YK0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Lrrc49Q91YK0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Lrrc49Q91YK0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Lrrc49Q91YK0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Lrrc49Q91YK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Lrrc49Q91YK0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Lrrc49Q91YK0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Lrrc49Q91YK0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Lrrc49Q91YK0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Lrrc49Q91YK0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Lrrc49Q91YK0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Lrrc49Q91YK0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Lrrc49Q91YK0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Lrrc49Q91YK0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Lrrc49Q91YK0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Lrrc49Q91YK0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Lrrc49Q91YK0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrrc49Q91YK0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrrc49Q91YK0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Lrrc49Q91YK0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Lrrc49Q91YK0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Lrrc49Q91YK0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Lrrc49Q91YK0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Lrrc49Q91YK0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Lrrc49Q91YK0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Lrrc49Q91YK0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Lrrc49Q91YK0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Lrrc49Q91YK0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Lrrc49Q91YK0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Lrrc49Q91YK0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Lrrc49Q91YK0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Lrrc49Q91YK0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Lrrc49Q91YK0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Lrrc49Q91YK0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Lrrc49Q91YK0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Lrrc49Q91YK0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Lrrc49Q91YK0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Lrrc49Q91YK0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
Lrrc49Q91YK0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Lrrc49Q91YK0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Lrrc49Q91YK0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Lrrc49Q91YK0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Lrrc49Q91YK0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Lrrc49Q91YK0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Lrrc49Q91YK0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Lrrc49Q91YK0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Lrrc49Q91YK0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Lrrc49Q91YK0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Lrrc49Q91YK0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Lrrc49Q91YK0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Lrrc49Q91YK0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Lrrc49Q91YK0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Lrrc49Q91YK0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Lrrc49Q91YK0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Lrrc49Q91YK0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Lrrc49Q91YK0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Lrrc49Q91YK0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Lrrc49Q91YK0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Lrrc49Q91YK0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Lrrc49Q91YK0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Lrrc49Q91YK0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,73■■□□□ 1,55
Lrrc49Q91YK0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Lrrc49Q91YK0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Lrrc49Q91YK0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Lrrc49Q91YK0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Lrrc49Q91YK0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Lrrc49Q91YK0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Lrrc49Q91YK0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Lrrc49Q91YK0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Lrrc49Q91YK0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,64■■□□□ 1,54
Lrrc49Q91YK0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Lrrc49Q91YK0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Lrrc49Q91YK0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Lrrc49Q91YK0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Lrrc49Q91YK0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Lrrc49Q91YK0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Lrrc49Q91YK0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Lrrc49Q91YK0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Lrrc49Q91YK0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Lrrc49Q91YK0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Lrrc49Q91YK0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,3 ms