Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Ppargc1bQ8VHJ7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
Ppargc1bQ8VHJ7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,58■■■■□ 3,93
Ppargc1bQ8VHJ7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,57■■■■□ 3,93
Ppargc1bQ8VHJ7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,57■■■■□ 3,93
Ppargc1bQ8VHJ7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39,56■■■■□ 3,92
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,55■■■■□ 3,92
Ppargc1bQ8VHJ7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Ppargc1bQ8VHJ7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39,47■■■■□ 3,91
Ppargc1bQ8VHJ7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Ppargc1bQ8VHJ7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,28■■■■□ 3,88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Ppargc1bQ8VHJ7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39,12■■■■□ 3,85
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Ppargc1bQ8VHJ7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,91■■■■□ 3,82
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,9■■■■□ 3,82
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38,87■■■■□ 3,81
Ppargc1bQ8VHJ7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,8
Ppargc1bQ8VHJ7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Ppargc1bQ8VHJ7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38,67■■■■□ 3,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38,65■■■■□ 3,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Ppargc1bQ8VHJ7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Ppargc1bQ8VHJ7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38,48■■■■□ 3,75
Ppargc1bQ8VHJ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,75
Ppargc1bQ8VHJ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38,45■■■■□ 3,75
Ppargc1bQ8VHJ7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Ppargc1bQ8VHJ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38,43■■■■□ 3,74
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Ppargc1bQ8VHJ7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38,37■■■■□ 3,73
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Ppargc1bQ8VHJ7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Ppargc1bQ8VHJ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38,23■■■■□ 3,71
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38,18■■■■□ 3,7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,18■■■■□ 3,7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Ppargc1bQ8VHJ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38,11■■■■□ 3,69
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Ppargc1bQ8VHJ7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38,1■■■■□ 3,69
Ppargc1bQ8VHJ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38,07■■■■□ 3,68
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38,06■■■■□ 3,68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,05■■■■□ 3,68
Ppargc1bQ8VHJ7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38,05■■■■□ 3,68
Ppargc1bQ8VHJ7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Ppargc1bQ8VHJ7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,94■■■■□ 3,66
Ppargc1bQ8VHJ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,89■■■■□ 3,66
Ppargc1bQ8VHJ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37,88■■■■□ 3,65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37,85■■■■□ 3,65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37,84■■■■□ 3,65
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,82■■■■□ 3,64
Ppargc1bQ8VHJ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Ppargc1bQ8VHJ7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC37,8■■■■□ 3,64
Ppargc1bQ8VHJ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37,73■■■■□ 3,63
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,62
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,61
Ppargc1bQ8VHJ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Ppargc1bQ8VHJ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37,61■■■■□ 3,61
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Ppargc1bQ8VHJ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms