Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD62

Bles03, UPF0696 protein C11orf68 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bles03Q8VD62 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bles03Q8VD62 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bles03Q8VD62 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Bles03Q8VD62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bles03Q8VD62 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bles03Q8VD62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bles03Q8VD62 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bles03Q8VD62 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bles03Q8VD62 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bles03Q8VD62 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bles03Q8VD62 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bles03Q8VD62 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bles03Q8VD62 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bles03Q8VD62 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bles03Q8VD62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bles03Q8VD62 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bles03Q8VD62 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bles03Q8VD62 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bles03Q8VD62 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bles03Q8VD62 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bles03Q8VD62 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bles03Q8VD62 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bles03Q8VD62 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bles03Q8VD62 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bles03Q8VD62 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bles03Q8VD62 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bles03Q8VD62 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Bles03Q8VD62 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bles03Q8VD62 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Bles03Q8VD62 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bles03Q8VD62 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bles03Q8VD62 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bles03Q8VD62 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bles03Q8VD62 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bles03Q8VD62 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Bles03Q8VD62 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bles03Q8VD62 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bles03Q8VD62 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bles03Q8VD62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bles03Q8VD62 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Bles03Q8VD62 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bles03Q8VD62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bles03Q8VD62 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bles03Q8VD62 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bles03Q8VD62 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bles03Q8VD62 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bles03Q8VD62 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bles03Q8VD62 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bles03Q8VD62 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bles03Q8VD62 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bles03Q8VD62 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bles03Q8VD62 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Bles03Q8VD62 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bles03Q8VD62 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bles03Q8VD62 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bles03Q8VD62 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bles03Q8VD62 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bles03Q8VD62 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bles03Q8VD62 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bles03Q8VD62 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bles03Q8VD62 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bles03Q8VD62 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bles03Q8VD62 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Bles03Q8VD62 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bles03Q8VD62 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bles03Q8VD62 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bles03Q8VD62 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bles03Q8VD62 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bles03Q8VD62 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bles03Q8VD62 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bles03Q8VD62 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bles03Q8VD62 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bles03Q8VD62 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bles03Q8VD62 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bles03Q8VD62 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bles03Q8VD62 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms