Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
0610009B22RikQ8R3W2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
0610009B22RikQ8R3W2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
0610009B22RikQ8R3W2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
0610009B22RikQ8R3W2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
0610009B22RikQ8R3W2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
0610009B22RikQ8R3W2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
0610009B22RikQ8R3W2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
0610009B22RikQ8R3W2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
0610009B22RikQ8R3W2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
0610009B22RikQ8R3W2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
0610009B22RikQ8R3W2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
0610009B22RikQ8R3W2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
0610009B22RikQ8R3W2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
0610009B22RikQ8R3W2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
0610009B22RikQ8R3W2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
0610009B22RikQ8R3W2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610009B22RikQ8R3W2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
0610009B22RikQ8R3W2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
0610009B22RikQ8R3W2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
0610009B22RikQ8R3W2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
0610009B22RikQ8R3W2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
0610009B22RikQ8R3W2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
0610009B22RikQ8R3W2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
0610009B22RikQ8R3W2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
0610009B22RikQ8R3W2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
0610009B22RikQ8R3W2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
0610009B22RikQ8R3W2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
0610009B22RikQ8R3W2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
0610009B22RikQ8R3W2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
0610009B22RikQ8R3W2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
0610009B22RikQ8R3W2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
0610009B22RikQ8R3W2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
0610009B22RikQ8R3W2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
0610009B22RikQ8R3W2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
0610009B22RikQ8R3W2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
0610009B22RikQ8R3W2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
0610009B22RikQ8R3W2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
0610009B22RikQ8R3W2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
0610009B22RikQ8R3W2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
0610009B22RikQ8R3W2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
0610009B22RikQ8R3W2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
0610009B22RikQ8R3W2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
0610009B22RikQ8R3W2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
0610009B22RikQ8R3W2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
0610009B22RikQ8R3W2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
0610009B22RikQ8R3W2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
0610009B22RikQ8R3W2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
0610009B22RikQ8R3W2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
0610009B22RikQ8R3W2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
0610009B22RikQ8R3W2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
0610009B22RikQ8R3W2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
0610009B22RikQ8R3W2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
0610009B22RikQ8R3W2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
0610009B22RikQ8R3W2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
0610009B22RikQ8R3W2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
0610009B22RikQ8R3W2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
0610009B22RikQ8R3W2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
0610009B22RikQ8R3W2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
0610009B22RikQ8R3W2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
0610009B22RikQ8R3W2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
0610009B22RikQ8R3W2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
0610009B22RikQ8R3W2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
0610009B22RikQ8R3W2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
0610009B22RikQ8R3W2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
0610009B22RikQ8R3W2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
0610009B22RikQ8R3W2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
0610009B22RikQ8R3W2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
0610009B22RikQ8R3W2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
0610009B22RikQ8R3W2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
0610009B22RikQ8R3W2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms